Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPZ3

Zc3h4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zc3h4Q6ZPZ3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zc3h4Q6ZPZ3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zc3h4Q6ZPZ3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zc3h4Q6ZPZ3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zc3h4Q6ZPZ3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zc3h4Q6ZPZ3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zc3h4Q6ZPZ3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Zc3h4Q6ZPZ3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Zc3h4Q6ZPZ3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Zc3h4Q6ZPZ3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Zc3h4Q6ZPZ3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Zc3h4Q6ZPZ3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Zc3h4Q6ZPZ3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zc3h4Q6ZPZ3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zc3h4Q6ZPZ3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zc3h4Q6ZPZ3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zc3h4Q6ZPZ3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zc3h4Q6ZPZ3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zc3h4Q6ZPZ3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zc3h4Q6ZPZ3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Zc3h4Q6ZPZ3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zc3h4Q6ZPZ3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zc3h4Q6ZPZ3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zc3h4Q6ZPZ3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zc3h4Q6ZPZ3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zc3h4Q6ZPZ3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zc3h4Q6ZPZ3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zc3h4Q6ZPZ3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zc3h4Q6ZPZ3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zc3h4Q6ZPZ3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zc3h4Q6ZPZ3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zc3h4Q6ZPZ3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zc3h4Q6ZPZ3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zc3h4Q6ZPZ3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zc3h4Q6ZPZ3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zc3h4Q6ZPZ3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zc3h4Q6ZPZ3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zc3h4Q6ZPZ3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zc3h4Q6ZPZ3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zc3h4Q6ZPZ3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zc3h4Q6ZPZ3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zc3h4Q6ZPZ3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Zc3h4Q6ZPZ3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zc3h4Q6ZPZ3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Zc3h4Q6ZPZ3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zc3h4Q6ZPZ3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zc3h4Q6ZPZ3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zc3h4Q6ZPZ3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zc3h4Q6ZPZ3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zc3h4Q6ZPZ3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zc3h4Q6ZPZ3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zc3h4Q6ZPZ3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zc3h4Q6ZPZ3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zc3h4Q6ZPZ3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zc3h4Q6ZPZ3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zc3h4Q6ZPZ3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zc3h4Q6ZPZ3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zc3h4Q6ZPZ3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zc3h4Q6ZPZ3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zc3h4Q6ZPZ3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zc3h4Q6ZPZ3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zc3h4Q6ZPZ3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Zc3h4Q6ZPZ3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zc3h4Q6ZPZ3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zc3h4Q6ZPZ3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zc3h4Q6ZPZ3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zc3h4Q6ZPZ3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zc3h4Q6ZPZ3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zc3h4Q6ZPZ3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zc3h4Q6ZPZ3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zc3h4Q6ZPZ3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zc3h4Q6ZPZ3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zc3h4Q6ZPZ3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zc3h4Q6ZPZ3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zc3h4Q6ZPZ3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Zc3h4Q6ZPZ3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zc3h4Q6ZPZ3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Zc3h4Q6ZPZ3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zc3h4Q6ZPZ3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zc3h4Q6ZPZ3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zc3h4Q6ZPZ3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zc3h4Q6ZPZ3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zc3h4Q6ZPZ3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Zc3h4Q6ZPZ3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zc3h4Q6ZPZ3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms