Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPQ6

Pitpnm2, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Pitpnm2Q6ZPQ6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Pitpnm2Q6ZPQ6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pitpnm2Q6ZPQ6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pitpnm2Q6ZPQ6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Pitpnm2Q6ZPQ6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pitpnm2Q6ZPQ6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pitpnm2Q6ZPQ6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pitpnm2Q6ZPQ6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pitpnm2Q6ZPQ6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pitpnm2Q6ZPQ6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pitpnm2Q6ZPQ6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pitpnm2Q6ZPQ6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pitpnm2Q6ZPQ6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Pitpnm2Q6ZPQ6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pitpnm2Q6ZPQ6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pitpnm2Q6ZPQ6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pitpnm2Q6ZPQ6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pitpnm2Q6ZPQ6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pitpnm2Q6ZPQ6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pitpnm2Q6ZPQ6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Pitpnm2Q6ZPQ6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pitpnm2Q6ZPQ6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pitpnm2Q6ZPQ6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pitpnm2Q6ZPQ6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pitpnm2Q6ZPQ6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Pitpnm2Q6ZPQ6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pitpnm2Q6ZPQ6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pitpnm2Q6ZPQ6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Pitpnm2Q6ZPQ6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pitpnm2Q6ZPQ6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pitpnm2Q6ZPQ6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pitpnm2Q6ZPQ6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pitpnm2Q6ZPQ6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pitpnm2Q6ZPQ6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pitpnm2Q6ZPQ6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pitpnm2Q6ZPQ6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pitpnm2Q6ZPQ6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pitpnm2Q6ZPQ6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pitpnm2Q6ZPQ6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Pitpnm2Q6ZPQ6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Pitpnm2Q6ZPQ6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pitpnm2Q6ZPQ6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pitpnm2Q6ZPQ6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pitpnm2Q6ZPQ6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pitpnm2Q6ZPQ6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pitpnm2Q6ZPQ6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pitpnm2Q6ZPQ6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pitpnm2Q6ZPQ6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pitpnm2Q6ZPQ6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pitpnm2Q6ZPQ6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pitpnm2Q6ZPQ6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pitpnm2Q6ZPQ6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pitpnm2Q6ZPQ6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pitpnm2Q6ZPQ6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pitpnm2Q6ZPQ6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pitpnm2Q6ZPQ6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pitpnm2Q6ZPQ6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pitpnm2Q6ZPQ6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pitpnm2Q6ZPQ6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pitpnm2Q6ZPQ6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pitpnm2Q6ZPQ6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pitpnm2Q6ZPQ6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pitpnm2Q6ZPQ6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pitpnm2Q6ZPQ6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pitpnm2Q6ZPQ6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pitpnm2Q6ZPQ6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pitpnm2Q6ZPQ6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pitpnm2Q6ZPQ6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pitpnm2Q6ZPQ6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pitpnm2Q6ZPQ6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pitpnm2Q6ZPQ6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pitpnm2Q6ZPQ6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pitpnm2Q6ZPQ6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pitpnm2Q6ZPQ6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pitpnm2Q6ZPQ6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pitpnm2Q6ZPQ6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pitpnm2Q6ZPQ6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pitpnm2Q6ZPQ6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pitpnm2Q6ZPQ6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pitpnm2Q6ZPQ6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pitpnm2Q6ZPQ6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pitpnm2Q6ZPQ6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pitpnm2Q6ZPQ6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pitpnm2Q6ZPQ6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.8
Pitpnm2Q6ZPQ6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pitpnm2Q6ZPQ6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms