Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cxcl3Q6W5C0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cxcl3Q6W5C0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cxcl3Q6W5C0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cxcl3Q6W5C0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cxcl3Q6W5C0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Cxcl3Q6W5C0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cxcl3Q6W5C0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cxcl3Q6W5C0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cxcl3Q6W5C0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cxcl3Q6W5C0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cxcl3Q6W5C0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Cxcl3Q6W5C0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cxcl3Q6W5C0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Cxcl3Q6W5C0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cxcl3Q6W5C0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cxcl3Q6W5C0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cxcl3Q6W5C0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Cxcl3Q6W5C0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cxcl3Q6W5C0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cxcl3Q6W5C0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cxcl3Q6W5C0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cxcl3Q6W5C0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cxcl3Q6W5C0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cxcl3Q6W5C0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cxcl3Q6W5C0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cxcl3Q6W5C0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Cxcl3Q6W5C0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cxcl3Q6W5C0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cxcl3Q6W5C0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cxcl3Q6W5C0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Cxcl3Q6W5C0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cxcl3Q6W5C0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cxcl3Q6W5C0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Cxcl3Q6W5C0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cxcl3Q6W5C0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cxcl3Q6W5C0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cxcl3Q6W5C0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cxcl3Q6W5C0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cxcl3Q6W5C0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cxcl3Q6W5C0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cxcl3Q6W5C0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cxcl3Q6W5C0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cxcl3Q6W5C0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cxcl3Q6W5C0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cxcl3Q6W5C0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cxcl3Q6W5C0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cxcl3Q6W5C0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cxcl3Q6W5C0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cxcl3Q6W5C0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cxcl3Q6W5C0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cxcl3Q6W5C0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cxcl3Q6W5C0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Cxcl3Q6W5C0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cxcl3Q6W5C0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cxcl3Q6W5C0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cxcl3Q6W5C0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cxcl3Q6W5C0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cxcl3Q6W5C0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cxcl3Q6W5C0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cxcl3Q6W5C0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cxcl3Q6W5C0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cxcl3Q6W5C0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cxcl3Q6W5C0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cxcl3Q6W5C0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cxcl3Q6W5C0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cxcl3Q6W5C0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cxcl3Q6W5C0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cxcl3Q6W5C0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cxcl3Q6W5C0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cxcl3Q6W5C0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cxcl3Q6W5C0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cxcl3Q6W5C0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cxcl3Q6W5C0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cxcl3Q6W5C0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cxcl3Q6W5C0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cxcl3Q6W5C0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cxcl3Q6W5C0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cxcl3Q6W5C0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cxcl3Q6W5C0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cxcl3Q6W5C0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cxcl3Q6W5C0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cxcl3Q6W5C0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cxcl3Q6W5C0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cxcl3Q6W5C0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cxcl3Q6W5C0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cxcl3Q6W5C0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cxcl3Q6W5C0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cxcl3Q6W5C0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cxcl3Q6W5C0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cxcl3Q6W5C0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cxcl3Q6W5C0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms