Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY53

AY358078, HN1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY358078Q6UY53 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AY358078Q6UY53 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AY358078Q6UY53 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AY358078Q6UY53 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AY358078Q6UY53 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AY358078Q6UY53 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AY358078Q6UY53 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AY358078Q6UY53 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AY358078Q6UY53 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AY358078Q6UY53 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AY358078Q6UY53 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AY358078Q6UY53 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
AY358078Q6UY53 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AY358078Q6UY53 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AY358078Q6UY53 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AY358078Q6UY53 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AY358078Q6UY53 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AY358078Q6UY53 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AY358078Q6UY53 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AY358078Q6UY53 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AY358078Q6UY53 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AY358078Q6UY53 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AY358078Q6UY53 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
AY358078Q6UY53 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AY358078Q6UY53 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AY358078Q6UY53 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AY358078Q6UY53 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AY358078Q6UY53 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AY358078Q6UY53 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AY358078Q6UY53 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AY358078Q6UY53 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
AY358078Q6UY53 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AY358078Q6UY53 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AY358078Q6UY53 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AY358078Q6UY53 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AY358078Q6UY53 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AY358078Q6UY53 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AY358078Q6UY53 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AY358078Q6UY53 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AY358078Q6UY53 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
AY358078Q6UY53 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AY358078Q6UY53 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AY358078Q6UY53 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AY358078Q6UY53 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AY358078Q6UY53 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
AY358078Q6UY53 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AY358078Q6UY53 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AY358078Q6UY53 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AY358078Q6UY53 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AY358078Q6UY53 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
AY358078Q6UY53 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AY358078Q6UY53 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AY358078Q6UY53 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AY358078Q6UY53 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
AY358078Q6UY53 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AY358078Q6UY53 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AY358078Q6UY53 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AY358078Q6UY53 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AY358078Q6UY53 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AY358078Q6UY53 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AY358078Q6UY53 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AY358078Q6UY53 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AY358078Q6UY53 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AY358078Q6UY53 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AY358078Q6UY53 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AY358078Q6UY53 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AY358078Q6UY53 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AY358078Q6UY53 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AY358078Q6UY53 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AY358078Q6UY53 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AY358078Q6UY53 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AY358078Q6UY53 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AY358078Q6UY53 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AY358078Q6UY53 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AY358078Q6UY53 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AY358078Q6UY53 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AY358078Q6UY53 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AY358078Q6UY53 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AY358078Q6UY53 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AY358078Q6UY53 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AY358078Q6UY53 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AY358078Q6UY53 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AY358078Q6UY53 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AY358078Q6UY53 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AY358078Q6UY53 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AY358078Q6UY53 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AY358078Q6UY53 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AY358078Q6UY53 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AY358078Q6UY53 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AY358078Q6UY53 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AY358078Q6UY53 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AY358078Q6UY53 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AY358078Q6UY53 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AY358078Q6UY53 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AY358078Q6UY53 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AY358078Q6UY53 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AY358078Q6UY53 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AY358078Q6UY53 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AY358078Q6UY53 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AY358078Q6UY53 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms