Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gramd2bQ6PEM6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gramd2bQ6PEM6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gramd2bQ6PEM6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gramd2bQ6PEM6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gramd2bQ6PEM6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gramd2bQ6PEM6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gramd2bQ6PEM6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gramd2bQ6PEM6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gramd2bQ6PEM6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gramd2bQ6PEM6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gramd2bQ6PEM6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gramd2bQ6PEM6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gramd2bQ6PEM6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gramd2bQ6PEM6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gramd2bQ6PEM6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gramd2bQ6PEM6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gramd2bQ6PEM6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gramd2bQ6PEM6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gramd2bQ6PEM6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gramd2bQ6PEM6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gramd2bQ6PEM6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gramd2bQ6PEM6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms