Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDN3

Mylk, Myosin light chain kinase, smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MylkQ6PDN3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MylkQ6PDN3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MylkQ6PDN3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MylkQ6PDN3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MylkQ6PDN3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MylkQ6PDN3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MylkQ6PDN3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MylkQ6PDN3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MylkQ6PDN3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MylkQ6PDN3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MylkQ6PDN3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MylkQ6PDN3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MylkQ6PDN3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MylkQ6PDN3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MylkQ6PDN3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MylkQ6PDN3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MylkQ6PDN3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MylkQ6PDN3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MylkQ6PDN3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MylkQ6PDN3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MylkQ6PDN3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MylkQ6PDN3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MylkQ6PDN3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MylkQ6PDN3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MylkQ6PDN3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MylkQ6PDN3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MylkQ6PDN3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MylkQ6PDN3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MylkQ6PDN3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MylkQ6PDN3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MylkQ6PDN3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MylkQ6PDN3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MylkQ6PDN3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MylkQ6PDN3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MylkQ6PDN3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MylkQ6PDN3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MylkQ6PDN3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MylkQ6PDN3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MylkQ6PDN3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MylkQ6PDN3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MylkQ6PDN3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MylkQ6PDN3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MylkQ6PDN3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MylkQ6PDN3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MylkQ6PDN3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MylkQ6PDN3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MylkQ6PDN3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MylkQ6PDN3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MylkQ6PDN3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MylkQ6PDN3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MylkQ6PDN3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MylkQ6PDN3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MylkQ6PDN3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MylkQ6PDN3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MylkQ6PDN3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MylkQ6PDN3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MylkQ6PDN3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MylkQ6PDN3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MylkQ6PDN3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MylkQ6PDN3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MylkQ6PDN3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MylkQ6PDN3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MylkQ6PDN3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MylkQ6PDN3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MylkQ6PDN3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MylkQ6PDN3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MylkQ6PDN3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MylkQ6PDN3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MylkQ6PDN3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MylkQ6PDN3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MylkQ6PDN3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MylkQ6PDN3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MylkQ6PDN3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MylkQ6PDN3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MylkQ6PDN3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MylkQ6PDN3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MylkQ6PDN3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MylkQ6PDN3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MylkQ6PDN3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MylkQ6PDN3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MylkQ6PDN3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MylkQ6PDN3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MylkQ6PDN3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MylkQ6PDN3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MylkQ6PDN3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MylkQ6PDN3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MylkQ6PDN3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MylkQ6PDN3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MylkQ6PDN3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MylkQ6PDN3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MylkQ6PDN3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MylkQ6PDN3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MylkQ6PDN3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MylkQ6PDN3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MylkQ6PDN3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MylkQ6PDN3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MylkQ6PDN3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MylkQ6PDN3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MylkQ6PDN3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MylkQ6PDN3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms