Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zbtb39Q6PDK0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Zbtb39Q6PDK0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Zbtb39Q6PDK0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Zbtb39Q6PDK0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Zbtb39Q6PDK0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zbtb39Q6PDK0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zbtb39Q6PDK0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zbtb39Q6PDK0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zbtb39Q6PDK0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zbtb39Q6PDK0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zbtb39Q6PDK0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zbtb39Q6PDK0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zbtb39Q6PDK0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zbtb39Q6PDK0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Zbtb39Q6PDK0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Zbtb39Q6PDK0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Zbtb39Q6PDK0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Zbtb39Q6PDK0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zbtb39Q6PDK0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zbtb39Q6PDK0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zbtb39Q6PDK0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zbtb39Q6PDK0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zbtb39Q6PDK0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Zbtb39Q6PDK0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Zbtb39Q6PDK0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Zbtb39Q6PDK0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zbtb39Q6PDK0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zbtb39Q6PDK0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zbtb39Q6PDK0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zbtb39Q6PDK0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zbtb39Q6PDK0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zbtb39Q6PDK0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zbtb39Q6PDK0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zbtb39Q6PDK0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zbtb39Q6PDK0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zbtb39Q6PDK0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zbtb39Q6PDK0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zbtb39Q6PDK0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zbtb39Q6PDK0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zbtb39Q6PDK0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zbtb39Q6PDK0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zbtb39Q6PDK0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zbtb39Q6PDK0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zbtb39Q6PDK0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Zbtb39Q6PDK0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zbtb39Q6PDK0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zbtb39Q6PDK0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Zbtb39Q6PDK0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Zbtb39Q6PDK0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Zbtb39Q6PDK0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Zbtb39Q6PDK0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Zbtb39Q6PDK0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zbtb39Q6PDK0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zbtb39Q6PDK0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zbtb39Q6PDK0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zbtb39Q6PDK0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zbtb39Q6PDK0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Zbtb39Q6PDK0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Zbtb39Q6PDK0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Zbtb39Q6PDK0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Zbtb39Q6PDK0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zbtb39Q6PDK0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zbtb39Q6PDK0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zbtb39Q6PDK0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zbtb39Q6PDK0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zbtb39Q6PDK0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zbtb39Q6PDK0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zbtb39Q6PDK0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zbtb39Q6PDK0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zbtb39Q6PDK0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zbtb39Q6PDK0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Zbtb39Q6PDK0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Zbtb39Q6PDK0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Zbtb39Q6PDK0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Zbtb39Q6PDK0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Zbtb39Q6PDK0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Zbtb39Q6PDK0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Zbtb39Q6PDK0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Zbtb39Q6PDK0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zbtb39Q6PDK0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zbtb39Q6PDK0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Zbtb39Q6PDK0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Zbtb39Q6PDK0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Zbtb39Q6PDK0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zbtb39Q6PDK0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zbtb39Q6PDK0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Zbtb39Q6PDK0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zbtb39Q6PDK0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zbtb39Q6PDK0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Zbtb39Q6PDK0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zbtb39Q6PDK0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zbtb39Q6PDK0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zbtb39Q6PDK0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zbtb39Q6PDK0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Zbtb39Q6PDK0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Zbtb39Q6PDK0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Zbtb39Q6PDK0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Zbtb39Q6PDK0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Zbtb39Q6PDK0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms