Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Smarcc2Q6PDG5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Smarcc2Q6PDG5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,3■■□□□ 1,8
Smarcc2Q6PDG5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26,3■■□□□ 1,8
Smarcc2Q6PDG5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Smarcc2Q6PDG5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Smarcc2Q6PDG5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Smarcc2Q6PDG5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Smarcc2Q6PDG5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Smarcc2Q6PDG5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Smarcc2Q6PDG5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Smarcc2Q6PDG5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Smarcc2Q6PDG5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Smarcc2Q6PDG5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Smarcc2Q6PDG5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26,25■■□□□ 1,79
Smarcc2Q6PDG5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Smarcc2Q6PDG5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Smarcc2Q6PDG5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26,25■■□□□ 1,79
Smarcc2Q6PDG5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Smarcc2Q6PDG5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Smarcc2Q6PDG5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Smarcc2Q6PDG5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Smarcc2Q6PDG5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Smarcc2Q6PDG5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Smarcc2Q6PDG5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Smarcc2Q6PDG5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Smarcc2Q6PDG5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Smarcc2Q6PDG5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26,23■■□□□ 1,79
Smarcc2Q6PDG5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Smarcc2Q6PDG5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26,22■■□□□ 1,79
Smarcc2Q6PDG5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Smarcc2Q6PDG5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26,22■■□□□ 1,79
Smarcc2Q6PDG5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26,22■■□□□ 1,79
Smarcc2Q6PDG5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Smarcc2Q6PDG5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Smarcc2Q6PDG5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Smarcc2Q6PDG5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26,21■■□□□ 1,79
Smarcc2Q6PDG5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Smarcc2Q6PDG5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,2■■□□□ 1,79
Smarcc2Q6PDG5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,79
Smarcc2Q6PDG5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26,2■■□□□ 1,78
Smarcc2Q6PDG5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Smarcc2Q6PDG5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Smarcc2Q6PDG5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26,19■■□□□ 1,78
Smarcc2Q6PDG5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Smarcc2Q6PDG5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26,19■■□□□ 1,78
Smarcc2Q6PDG5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Smarcc2Q6PDG5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Smarcc2Q6PDG5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26,19■■□□□ 1,78
Smarcc2Q6PDG5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Smarcc2Q6PDG5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Smarcc2Q6PDG5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Smarcc2Q6PDG5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Smarcc2Q6PDG5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Smarcc2Q6PDG5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Smarcc2Q6PDG5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26,17■■□□□ 1,78
Smarcc2Q6PDG5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26,17■■□□□ 1,78
Smarcc2Q6PDG5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Smarcc2Q6PDG5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Smarcc2Q6PDG5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Smarcc2Q6PDG5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Smarcc2Q6PDG5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26,15■■□□□ 1,78
Smarcc2Q6PDG5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Smarcc2Q6PDG5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Smarcc2Q6PDG5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Smarcc2Q6PDG5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26,14■■□□□ 1,77
Smarcc2Q6PDG5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26,13■■□□□ 1,77
Smarcc2Q6PDG5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26,13■■□□□ 1,77
Smarcc2Q6PDG5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26,13■■□□□ 1,77
Smarcc2Q6PDG5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Smarcc2Q6PDG5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Smarcc2Q6PDG5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Smarcc2Q6PDG5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Smarcc2Q6PDG5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26,12■■□□□ 1,77
Smarcc2Q6PDG5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Smarcc2Q6PDG5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Smarcc2Q6PDG5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Smarcc2Q6PDG5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Smarcc2Q6PDG5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Smarcc2Q6PDG5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26,11■■□□□ 1,77
Smarcc2Q6PDG5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Smarcc2Q6PDG5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Smarcc2Q6PDG5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,1■■□□□ 1,77
Smarcc2Q6PDG5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,1■■□□□ 1,77
Smarcc2Q6PDG5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Smarcc2Q6PDG5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Smarcc2Q6PDG5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Smarcc2Q6PDG5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26,09■■□□□ 1,77
Smarcc2Q6PDG5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Smarcc2Q6PDG5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Smarcc2Q6PDG5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Smarcc2Q6PDG5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Smarcc2Q6PDG5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Smarcc2Q6PDG5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Smarcc2Q6PDG5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Smarcc2Q6PDG5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Smarcc2Q6PDG5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Smarcc2Q6PDG5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Smarcc2Q6PDG5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Smarcc2Q6PDG5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26,05■■□□□ 1,76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,5 ms