Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sik3Q6P4S6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sik3Q6P4S6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sik3Q6P4S6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sik3Q6P4S6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sik3Q6P4S6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sik3Q6P4S6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sik3Q6P4S6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sik3Q6P4S6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sik3Q6P4S6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sik3Q6P4S6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sik3Q6P4S6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sik3Q6P4S6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sik3Q6P4S6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sik3Q6P4S6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sik3Q6P4S6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sik3Q6P4S6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sik3Q6P4S6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sik3Q6P4S6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sik3Q6P4S6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sik3Q6P4S6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sik3Q6P4S6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sik3Q6P4S6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sik3Q6P4S6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sik3Q6P4S6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sik3Q6P4S6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sik3Q6P4S6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Sik3Q6P4S6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sik3Q6P4S6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sik3Q6P4S6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sik3Q6P4S6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sik3Q6P4S6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sik3Q6P4S6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sik3Q6P4S6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sik3Q6P4S6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sik3Q6P4S6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sik3Q6P4S6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sik3Q6P4S6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sik3Q6P4S6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sik3Q6P4S6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sik3Q6P4S6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sik3Q6P4S6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sik3Q6P4S6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sik3Q6P4S6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sik3Q6P4S6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sik3Q6P4S6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sik3Q6P4S6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sik3Q6P4S6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sik3Q6P4S6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sik3Q6P4S6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sik3Q6P4S6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sik3Q6P4S6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sik3Q6P4S6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sik3Q6P4S6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sik3Q6P4S6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sik3Q6P4S6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sik3Q6P4S6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sik3Q6P4S6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sik3Q6P4S6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Sik3Q6P4S6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sik3Q6P4S6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sik3Q6P4S6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sik3Q6P4S6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sik3Q6P4S6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sik3Q6P4S6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sik3Q6P4S6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sik3Q6P4S6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sik3Q6P4S6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sik3Q6P4S6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sik3Q6P4S6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sik3Q6P4S6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Sik3Q6P4S6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sik3Q6P4S6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Sik3Q6P4S6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sik3Q6P4S6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sik3Q6P4S6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sik3Q6P4S6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sik3Q6P4S6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sik3Q6P4S6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sik3Q6P4S6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sik3Q6P4S6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sik3Q6P4S6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sik3Q6P4S6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sik3Q6P4S6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sik3Q6P4S6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sik3Q6P4S6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sik3Q6P4S6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sik3Q6P4S6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sik3Q6P4S6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sik3Q6P4S6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sik3Q6P4S6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sik3Q6P4S6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sik3Q6P4S6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sik3Q6P4S6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Sik3Q6P4S6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sik3Q6P4S6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Sik3Q6P4S6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sik3Q6P4S6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sik3Q6P4S6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sik3Q6P4S6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms