Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac10Q6P3E7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac10Q6P3E7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac10Q6P3E7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac10Q6P3E7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac10Q6P3E7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac10Q6P3E7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac10Q6P3E7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hdac10Q6P3E7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hdac10Q6P3E7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac10Q6P3E7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdac10Q6P3E7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac10Q6P3E7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac10Q6P3E7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac10Q6P3E7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac10Q6P3E7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac10Q6P3E7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdac10Q6P3E7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac10Q6P3E7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac10Q6P3E7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac10Q6P3E7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdac10Q6P3E7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac10Q6P3E7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac10Q6P3E7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac10Q6P3E7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdac10Q6P3E7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac10Q6P3E7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac10Q6P3E7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac10Q6P3E7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac10Q6P3E7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac10Q6P3E7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac10Q6P3E7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdac10Q6P3E7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac10Q6P3E7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac10Q6P3E7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac10Q6P3E7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac10Q6P3E7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac10Q6P3E7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac10Q6P3E7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac10Q6P3E7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac10Q6P3E7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac10Q6P3E7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac10Q6P3E7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac10Q6P3E7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac10Q6P3E7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac10Q6P3E7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac10Q6P3E7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac10Q6P3E7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac10Q6P3E7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac10Q6P3E7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac10Q6P3E7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac10Q6P3E7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac10Q6P3E7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac10Q6P3E7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac10Q6P3E7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac10Q6P3E7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac10Q6P3E7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac10Q6P3E7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac10Q6P3E7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac10Q6P3E7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdac10Q6P3E7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdac10Q6P3E7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac10Q6P3E7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac10Q6P3E7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac10Q6P3E7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac10Q6P3E7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac10Q6P3E7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac10Q6P3E7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac10Q6P3E7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac10Q6P3E7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac10Q6P3E7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac10Q6P3E7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac10Q6P3E7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac10Q6P3E7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac10Q6P3E7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac10Q6P3E7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac10Q6P3E7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac10Q6P3E7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac10Q6P3E7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac10Q6P3E7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac10Q6P3E7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac10Q6P3E7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hdac10Q6P3E7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hdac10Q6P3E7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hdac10Q6P3E7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac10Q6P3E7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac10Q6P3E7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac10Q6P3E7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac10Q6P3E7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac10Q6P3E7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac10Q6P3E7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac10Q6P3E7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac10Q6P3E7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac10Q6P3E7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac10Q6P3E7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac10Q6P3E7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac10Q6P3E7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac10Q6P3E7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac10Q6P3E7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac10Q6P3E7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 243.5 ms