Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PrimpolQ6P1E7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PrimpolQ6P1E7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PrimpolQ6P1E7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PrimpolQ6P1E7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PrimpolQ6P1E7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PrimpolQ6P1E7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PrimpolQ6P1E7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PrimpolQ6P1E7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PrimpolQ6P1E7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PrimpolQ6P1E7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PrimpolQ6P1E7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PrimpolQ6P1E7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PrimpolQ6P1E7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PrimpolQ6P1E7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PrimpolQ6P1E7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PrimpolQ6P1E7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PrimpolQ6P1E7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PrimpolQ6P1E7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PrimpolQ6P1E7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PrimpolQ6P1E7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PrimpolQ6P1E7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PrimpolQ6P1E7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PrimpolQ6P1E7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PrimpolQ6P1E7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PrimpolQ6P1E7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PrimpolQ6P1E7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PrimpolQ6P1E7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PrimpolQ6P1E7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PrimpolQ6P1E7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PrimpolQ6P1E7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PrimpolQ6P1E7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PrimpolQ6P1E7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PrimpolQ6P1E7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PrimpolQ6P1E7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms