Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Soga3Q6NZL0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Soga3Q6NZL0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Soga3Q6NZL0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Soga3Q6NZL0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Soga3Q6NZL0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Soga3Q6NZL0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Soga3Q6NZL0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Soga3Q6NZL0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Soga3Q6NZL0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Soga3Q6NZL0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Soga3Q6NZL0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Soga3Q6NZL0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Soga3Q6NZL0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Soga3Q6NZL0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Soga3Q6NZL0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Soga3Q6NZL0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Soga3Q6NZL0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Soga3Q6NZL0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Soga3Q6NZL0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Soga3Q6NZL0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Soga3Q6NZL0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Soga3Q6NZL0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Soga3Q6NZL0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Soga3Q6NZL0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Soga3Q6NZL0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Soga3Q6NZL0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Soga3Q6NZL0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Soga3Q6NZL0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Soga3Q6NZL0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Soga3Q6NZL0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Soga3Q6NZL0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Soga3Q6NZL0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Soga3Q6NZL0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Soga3Q6NZL0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Soga3Q6NZL0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Soga3Q6NZL0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Soga3Q6NZL0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Soga3Q6NZL0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Soga3Q6NZL0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Soga3Q6NZL0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Soga3Q6NZL0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Soga3Q6NZL0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Soga3Q6NZL0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Soga3Q6NZL0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Soga3Q6NZL0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Soga3Q6NZL0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Soga3Q6NZL0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Soga3Q6NZL0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Soga3Q6NZL0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Soga3Q6NZL0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Soga3Q6NZL0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Soga3Q6NZL0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Soga3Q6NZL0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Soga3Q6NZL0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Soga3Q6NZL0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Soga3Q6NZL0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Soga3Q6NZL0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Soga3Q6NZL0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Soga3Q6NZL0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Soga3Q6NZL0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Soga3Q6NZL0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Soga3Q6NZL0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Soga3Q6NZL0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Soga3Q6NZL0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Soga3Q6NZL0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Soga3Q6NZL0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Soga3Q6NZL0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Soga3Q6NZL0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Soga3Q6NZL0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Soga3Q6NZL0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Soga3Q6NZL0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Soga3Q6NZL0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Soga3Q6NZL0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Soga3Q6NZL0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Soga3Q6NZL0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Soga3Q6NZL0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Soga3Q6NZL0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Soga3Q6NZL0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Soga3Q6NZL0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Soga3Q6NZL0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Soga3Q6NZL0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Soga3Q6NZL0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Soga3Q6NZL0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Soga3Q6NZL0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Soga3Q6NZL0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Soga3Q6NZL0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Soga3Q6NZL0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Soga3Q6NZL0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Soga3Q6NZL0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Soga3Q6NZL0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Soga3Q6NZL0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Soga3Q6NZL0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Soga3Q6NZL0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Soga3Q6NZL0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Soga3Q6NZL0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Soga3Q6NZL0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Soga3Q6NZL0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Soga3Q6NZL0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Soga3Q6NZL0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms