Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sec23ipQ6NZC7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sec23ipQ6NZC7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sec23ipQ6NZC7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sec23ipQ6NZC7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sec23ipQ6NZC7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sec23ipQ6NZC7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sec23ipQ6NZC7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sec23ipQ6NZC7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sec23ipQ6NZC7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sec23ipQ6NZC7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sec23ipQ6NZC7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sec23ipQ6NZC7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sec23ipQ6NZC7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sec23ipQ6NZC7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Sec23ipQ6NZC7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Sec23ipQ6NZC7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec23ipQ6NZC7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec23ipQ6NZC7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec23ipQ6NZC7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec23ipQ6NZC7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec23ipQ6NZC7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec23ipQ6NZC7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec23ipQ6NZC7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec23ipQ6NZC7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sec23ipQ6NZC7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sec23ipQ6NZC7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sec23ipQ6NZC7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sec23ipQ6NZC7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sec23ipQ6NZC7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sec23ipQ6NZC7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sec23ipQ6NZC7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sec23ipQ6NZC7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sec23ipQ6NZC7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec23ipQ6NZC7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec23ipQ6NZC7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec23ipQ6NZC7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec23ipQ6NZC7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec23ipQ6NZC7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec23ipQ6NZC7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec23ipQ6NZC7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec23ipQ6NZC7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec23ipQ6NZC7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec23ipQ6NZC7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec23ipQ6NZC7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec23ipQ6NZC7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec23ipQ6NZC7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec23ipQ6NZC7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec23ipQ6NZC7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sec23ipQ6NZC7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sec23ipQ6NZC7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sec23ipQ6NZC7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sec23ipQ6NZC7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sec23ipQ6NZC7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sec23ipQ6NZC7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sec23ipQ6NZC7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sec23ipQ6NZC7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sec23ipQ6NZC7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sec23ipQ6NZC7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sec23ipQ6NZC7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sec23ipQ6NZC7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sec23ipQ6NZC7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sec23ipQ6NZC7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sec23ipQ6NZC7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sec23ipQ6NZC7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sec23ipQ6NZC7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sec23ipQ6NZC7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sec23ipQ6NZC7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sec23ipQ6NZC7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sec23ipQ6NZC7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sec23ipQ6NZC7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sec23ipQ6NZC7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sec23ipQ6NZC7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sec23ipQ6NZC7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sec23ipQ6NZC7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sec23ipQ6NZC7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sec23ipQ6NZC7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sec23ipQ6NZC7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sec23ipQ6NZC7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sec23ipQ6NZC7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sec23ipQ6NZC7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sec23ipQ6NZC7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sec23ipQ6NZC7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sec23ipQ6NZC7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sec23ipQ6NZC7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sec23ipQ6NZC7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms