Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gpbp1Q6NXH3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gpbp1Q6NXH3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gpbp1Q6NXH3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gpbp1Q6NXH3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gpbp1Q6NXH3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gpbp1Q6NXH3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gpbp1Q6NXH3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gpbp1Q6NXH3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gpbp1Q6NXH3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gpbp1Q6NXH3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gpbp1Q6NXH3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gpbp1Q6NXH3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Gpbp1Q6NXH3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gpbp1Q6NXH3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gpbp1Q6NXH3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gpbp1Q6NXH3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gpbp1Q6NXH3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gpbp1Q6NXH3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gpbp1Q6NXH3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gpbp1Q6NXH3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gpbp1Q6NXH3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gpbp1Q6NXH3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gpbp1Q6NXH3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gpbp1Q6NXH3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gpbp1Q6NXH3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gpbp1Q6NXH3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Gpbp1Q6NXH3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gpbp1Q6NXH3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gpbp1Q6NXH3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gpbp1Q6NXH3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gpbp1Q6NXH3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gpbp1Q6NXH3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gpbp1Q6NXH3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gpbp1Q6NXH3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gpbp1Q6NXH3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gpbp1Q6NXH3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gpbp1Q6NXH3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Gpbp1Q6NXH3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gpbp1Q6NXH3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gpbp1Q6NXH3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gpbp1Q6NXH3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Gpbp1Q6NXH3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gpbp1Q6NXH3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gpbp1Q6NXH3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gpbp1Q6NXH3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gpbp1Q6NXH3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gpbp1Q6NXH3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gpbp1Q6NXH3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Gpbp1Q6NXH3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gpbp1Q6NXH3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gpbp1Q6NXH3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gpbp1Q6NXH3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gpbp1Q6NXH3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gpbp1Q6NXH3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gpbp1Q6NXH3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gpbp1Q6NXH3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gpbp1Q6NXH3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gpbp1Q6NXH3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gpbp1Q6NXH3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gpbp1Q6NXH3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gpbp1Q6NXH3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gpbp1Q6NXH3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gpbp1Q6NXH3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gpbp1Q6NXH3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gpbp1Q6NXH3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gpbp1Q6NXH3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gpbp1Q6NXH3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Gpbp1Q6NXH3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gpbp1Q6NXH3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gpbp1Q6NXH3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gpbp1Q6NXH3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gpbp1Q6NXH3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gpbp1Q6NXH3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gpbp1Q6NXH3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gpbp1Q6NXH3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gpbp1Q6NXH3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gpbp1Q6NXH3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gpbp1Q6NXH3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gpbp1Q6NXH3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gpbp1Q6NXH3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gpbp1Q6NXH3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gpbp1Q6NXH3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gpbp1Q6NXH3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gpbp1Q6NXH3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gpbp1Q6NXH3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gpbp1Q6NXH3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gpbp1Q6NXH3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gpbp1Q6NXH3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gpbp1Q6NXH3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gpbp1Q6NXH3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gpbp1Q6NXH3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gpbp1Q6NXH3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gpbp1Q6NXH3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gpbp1Q6NXH3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gpbp1Q6NXH3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Gpbp1Q6NXH3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gpbp1Q6NXH3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gpbp1Q6NXH3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gpbp1Q6NXH3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms