Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH0

Tvp23a, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23aQ6NVH0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tvp23aQ6NVH0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tvp23aQ6NVH0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tvp23aQ6NVH0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tvp23aQ6NVH0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tvp23aQ6NVH0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tvp23aQ6NVH0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tvp23aQ6NVH0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tvp23aQ6NVH0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tvp23aQ6NVH0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tvp23aQ6NVH0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tvp23aQ6NVH0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tvp23aQ6NVH0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tvp23aQ6NVH0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tvp23aQ6NVH0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tvp23aQ6NVH0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tvp23aQ6NVH0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tvp23aQ6NVH0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tvp23aQ6NVH0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tvp23aQ6NVH0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tvp23aQ6NVH0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tvp23aQ6NVH0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tvp23aQ6NVH0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tvp23aQ6NVH0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tvp23aQ6NVH0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tvp23aQ6NVH0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tvp23aQ6NVH0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tvp23aQ6NVH0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tvp23aQ6NVH0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tvp23aQ6NVH0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tvp23aQ6NVH0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tvp23aQ6NVH0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tvp23aQ6NVH0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tvp23aQ6NVH0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tvp23aQ6NVH0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tvp23aQ6NVH0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tvp23aQ6NVH0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tvp23aQ6NVH0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tvp23aQ6NVH0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tvp23aQ6NVH0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tvp23aQ6NVH0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tvp23aQ6NVH0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tvp23aQ6NVH0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tvp23aQ6NVH0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tvp23aQ6NVH0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tvp23aQ6NVH0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tvp23aQ6NVH0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tvp23aQ6NVH0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tvp23aQ6NVH0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tvp23aQ6NVH0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tvp23aQ6NVH0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tvp23aQ6NVH0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tvp23aQ6NVH0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tvp23aQ6NVH0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tvp23aQ6NVH0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tvp23aQ6NVH0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tvp23aQ6NVH0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tvp23aQ6NVH0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tvp23aQ6NVH0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tvp23aQ6NVH0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tvp23aQ6NVH0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tvp23aQ6NVH0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tvp23aQ6NVH0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tvp23aQ6NVH0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tvp23aQ6NVH0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tvp23aQ6NVH0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tvp23aQ6NVH0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tvp23aQ6NVH0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tvp23aQ6NVH0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tvp23aQ6NVH0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tvp23aQ6NVH0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tvp23aQ6NVH0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tvp23aQ6NVH0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tvp23aQ6NVH0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tvp23aQ6NVH0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tvp23aQ6NVH0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tvp23aQ6NVH0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tvp23aQ6NVH0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tvp23aQ6NVH0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tvp23aQ6NVH0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tvp23aQ6NVH0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tvp23aQ6NVH0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tvp23aQ6NVH0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tvp23aQ6NVH0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tvp23aQ6NVH0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tvp23aQ6NVH0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tvp23aQ6NVH0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tvp23aQ6NVH0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tvp23aQ6NVH0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tvp23aQ6NVH0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tvp23aQ6NVH0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tvp23aQ6NVH0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tvp23aQ6NVH0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tvp23aQ6NVH0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tvp23aQ6NVH0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tvp23aQ6NVH0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tvp23aQ6NVH0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tvp23aQ6NVH0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Tvp23aQ6NVH0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tvp23aQ6NVH0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms