Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frem2Q6NVD0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frem2Q6NVD0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frem2Q6NVD0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frem2Q6NVD0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frem2Q6NVD0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Frem2Q6NVD0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Frem2Q6NVD0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Frem2Q6NVD0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Frem2Q6NVD0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Frem2Q6NVD0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Frem2Q6NVD0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Frem2Q6NVD0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frem2Q6NVD0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frem2Q6NVD0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frem2Q6NVD0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frem2Q6NVD0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frem2Q6NVD0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frem2Q6NVD0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frem2Q6NVD0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frem2Q6NVD0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frem2Q6NVD0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frem2Q6NVD0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frem2Q6NVD0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frem2Q6NVD0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frem2Q6NVD0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frem2Q6NVD0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Frem2Q6NVD0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frem2Q6NVD0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frem2Q6NVD0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frem2Q6NVD0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frem2Q6NVD0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frem2Q6NVD0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frem2Q6NVD0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frem2Q6NVD0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frem2Q6NVD0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frem2Q6NVD0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frem2Q6NVD0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frem2Q6NVD0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Frem2Q6NVD0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Frem2Q6NVD0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Frem2Q6NVD0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Frem2Q6NVD0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Frem2Q6NVD0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Frem2Q6NVD0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Frem2Q6NVD0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Frem2Q6NVD0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Frem2Q6NVD0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Frem2Q6NVD0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Frem2Q6NVD0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Frem2Q6NVD0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frem2Q6NVD0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frem2Q6NVD0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Frem2Q6NVD0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Frem2Q6NVD0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frem2Q6NVD0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frem2Q6NVD0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frem2Q6NVD0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frem2Q6NVD0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frem2Q6NVD0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frem2Q6NVD0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Frem2Q6NVD0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Frem2Q6NVD0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Frem2Q6NVD0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Frem2Q6NVD0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Frem2Q6NVD0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Frem2Q6NVD0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Frem2Q6NVD0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Frem2Q6NVD0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frem2Q6NVD0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frem2Q6NVD0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frem2Q6NVD0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frem2Q6NVD0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frem2Q6NVD0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frem2Q6NVD0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frem2Q6NVD0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frem2Q6NVD0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Frem2Q6NVD0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Frem2Q6NVD0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Frem2Q6NVD0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Frem2Q6NVD0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Frem2Q6NVD0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Frem2Q6NVD0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Frem2Q6NVD0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Frem2Q6NVD0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Frem2Q6NVD0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Frem2Q6NVD0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frem2Q6NVD0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frem2Q6NVD0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frem2Q6NVD0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frem2Q6NVD0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frem2Q6NVD0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frem2Q6NVD0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frem2Q6NVD0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frem2Q6NVD0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Frem2Q6NVD0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Frem2Q6NVD0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Frem2Q6NVD0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Frem2Q6NVD0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Frem2Q6NVD0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms