Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sp140Q6NSQ5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sp140Q6NSQ5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sp140Q6NSQ5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sp140Q6NSQ5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sp140Q6NSQ5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sp140Q6NSQ5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sp140Q6NSQ5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sp140Q6NSQ5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sp140Q6NSQ5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sp140Q6NSQ5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sp140Q6NSQ5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sp140Q6NSQ5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sp140Q6NSQ5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sp140Q6NSQ5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sp140Q6NSQ5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sp140Q6NSQ5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sp140Q6NSQ5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sp140Q6NSQ5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sp140Q6NSQ5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sp140Q6NSQ5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sp140Q6NSQ5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sp140Q6NSQ5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sp140Q6NSQ5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sp140Q6NSQ5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sp140Q6NSQ5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sp140Q6NSQ5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sp140Q6NSQ5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sp140Q6NSQ5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sp140Q6NSQ5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sp140Q6NSQ5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sp140Q6NSQ5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sp140Q6NSQ5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sp140Q6NSQ5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sp140Q6NSQ5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sp140Q6NSQ5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sp140Q6NSQ5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sp140Q6NSQ5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sp140Q6NSQ5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sp140Q6NSQ5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sp140Q6NSQ5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sp140Q6NSQ5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sp140Q6NSQ5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sp140Q6NSQ5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sp140Q6NSQ5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sp140Q6NSQ5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sp140Q6NSQ5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sp140Q6NSQ5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sp140Q6NSQ5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sp140Q6NSQ5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sp140Q6NSQ5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sp140Q6NSQ5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sp140Q6NSQ5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sp140Q6NSQ5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sp140Q6NSQ5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sp140Q6NSQ5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sp140Q6NSQ5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sp140Q6NSQ5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sp140Q6NSQ5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sp140Q6NSQ5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sp140Q6NSQ5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sp140Q6NSQ5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sp140Q6NSQ5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sp140Q6NSQ5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sp140Q6NSQ5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sp140Q6NSQ5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sp140Q6NSQ5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sp140Q6NSQ5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sp140Q6NSQ5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sp140Q6NSQ5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sp140Q6NSQ5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sp140Q6NSQ5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sp140Q6NSQ5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sp140Q6NSQ5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sp140Q6NSQ5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sp140Q6NSQ5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sp140Q6NSQ5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sp140Q6NSQ5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sp140Q6NSQ5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sp140Q6NSQ5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sp140Q6NSQ5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sp140Q6NSQ5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sp140Q6NSQ5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sp140Q6NSQ5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sp140Q6NSQ5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sp140Q6NSQ5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sp140Q6NSQ5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sp140Q6NSQ5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sp140Q6NSQ5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sp140Q6NSQ5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sp140Q6NSQ5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sp140Q6NSQ5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sp140Q6NSQ5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sp140Q6NSQ5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sp140Q6NSQ5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sp140Q6NSQ5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sp140Q6NSQ5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sp140Q6NSQ5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sp140Q6NSQ5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sp140Q6NSQ5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms