Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CltbQ6IRU5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CltbQ6IRU5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CltbQ6IRU5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CltbQ6IRU5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CltbQ6IRU5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CltbQ6IRU5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CltbQ6IRU5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CltbQ6IRU5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CltbQ6IRU5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CltbQ6IRU5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CltbQ6IRU5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CltbQ6IRU5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CltbQ6IRU5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CltbQ6IRU5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CltbQ6IRU5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CltbQ6IRU5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CltbQ6IRU5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CltbQ6IRU5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CltbQ6IRU5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CltbQ6IRU5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CltbQ6IRU5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CltbQ6IRU5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CltbQ6IRU5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CltbQ6IRU5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CltbQ6IRU5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CltbQ6IRU5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CltbQ6IRU5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CltbQ6IRU5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CltbQ6IRU5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CltbQ6IRU5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CltbQ6IRU5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CltbQ6IRU5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CltbQ6IRU5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CltbQ6IRU5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CltbQ6IRU5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CltbQ6IRU5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CltbQ6IRU5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CltbQ6IRU5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CltbQ6IRU5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CltbQ6IRU5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CltbQ6IRU5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CltbQ6IRU5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CltbQ6IRU5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CltbQ6IRU5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CltbQ6IRU5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CltbQ6IRU5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CltbQ6IRU5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CltbQ6IRU5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CltbQ6IRU5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CltbQ6IRU5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CltbQ6IRU5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CltbQ6IRU5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CltbQ6IRU5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CltbQ6IRU5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CltbQ6IRU5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CltbQ6IRU5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CltbQ6IRU5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CltbQ6IRU5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CltbQ6IRU5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CltbQ6IRU5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CltbQ6IRU5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CltbQ6IRU5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CltbQ6IRU5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CltbQ6IRU5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CltbQ6IRU5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CltbQ6IRU5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CltbQ6IRU5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CltbQ6IRU5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CltbQ6IRU5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CltbQ6IRU5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CltbQ6IRU5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CltbQ6IRU5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CltbQ6IRU5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CltbQ6IRU5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CltbQ6IRU5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CltbQ6IRU5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CltbQ6IRU5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CltbQ6IRU5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CltbQ6IRU5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CltbQ6IRU5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CltbQ6IRU5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CltbQ6IRU5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CltbQ6IRU5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CltbQ6IRU5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CltbQ6IRU5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CltbQ6IRU5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CltbQ6IRU5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CltbQ6IRU5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CltbQ6IRU5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CltbQ6IRU5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CltbQ6IRU5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CltbQ6IRU5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CltbQ6IRU5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CltbQ6IRU5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CltbQ6IRU5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CltbQ6IRU5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CltbQ6IRU5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CltbQ6IRU5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CltbQ6IRU5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms