Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Edrf1Q6GQV7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Edrf1Q6GQV7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Edrf1Q6GQV7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Edrf1Q6GQV7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Edrf1Q6GQV7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Edrf1Q6GQV7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Edrf1Q6GQV7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Edrf1Q6GQV7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Edrf1Q6GQV7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Edrf1Q6GQV7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Edrf1Q6GQV7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Edrf1Q6GQV7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Edrf1Q6GQV7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Edrf1Q6GQV7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Edrf1Q6GQV7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Edrf1Q6GQV7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Edrf1Q6GQV7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Edrf1Q6GQV7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Edrf1Q6GQV7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Edrf1Q6GQV7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Edrf1Q6GQV7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Edrf1Q6GQV7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Edrf1Q6GQV7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Edrf1Q6GQV7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Edrf1Q6GQV7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Edrf1Q6GQV7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Edrf1Q6GQV7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Edrf1Q6GQV7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Edrf1Q6GQV7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Edrf1Q6GQV7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Edrf1Q6GQV7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Edrf1Q6GQV7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Edrf1Q6GQV7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Edrf1Q6GQV7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Edrf1Q6GQV7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Edrf1Q6GQV7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Edrf1Q6GQV7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Edrf1Q6GQV7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Edrf1Q6GQV7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Edrf1Q6GQV7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Edrf1Q6GQV7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Edrf1Q6GQV7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Edrf1Q6GQV7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Edrf1Q6GQV7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Edrf1Q6GQV7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Edrf1Q6GQV7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Edrf1Q6GQV7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Edrf1Q6GQV7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Edrf1Q6GQV7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Edrf1Q6GQV7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Edrf1Q6GQV7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Edrf1Q6GQV7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Edrf1Q6GQV7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Edrf1Q6GQV7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Edrf1Q6GQV7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Edrf1Q6GQV7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Edrf1Q6GQV7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Edrf1Q6GQV7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Edrf1Q6GQV7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Edrf1Q6GQV7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Edrf1Q6GQV7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Edrf1Q6GQV7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Edrf1Q6GQV7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Edrf1Q6GQV7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Edrf1Q6GQV7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Edrf1Q6GQV7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Edrf1Q6GQV7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Edrf1Q6GQV7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Edrf1Q6GQV7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Edrf1Q6GQV7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Edrf1Q6GQV7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Edrf1Q6GQV7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Edrf1Q6GQV7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Edrf1Q6GQV7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Edrf1Q6GQV7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Edrf1Q6GQV7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Edrf1Q6GQV7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Edrf1Q6GQV7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Edrf1Q6GQV7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Edrf1Q6GQV7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Edrf1Q6GQV7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Edrf1Q6GQV7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Edrf1Q6GQV7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Edrf1Q6GQV7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Edrf1Q6GQV7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Edrf1Q6GQV7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Edrf1Q6GQV7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Edrf1Q6GQV7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Edrf1Q6GQV7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Edrf1Q6GQV7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Edrf1Q6GQV7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Edrf1Q6GQV7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Edrf1Q6GQV7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Edrf1Q6GQV7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Edrf1Q6GQV7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Edrf1Q6GQV7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Edrf1Q6GQV7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Edrf1Q6GQV7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Edrf1Q6GQV7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms