Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Nop58Q6DFW4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Nop58Q6DFW4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Nop58Q6DFW4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Nop58Q6DFW4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Nop58Q6DFW4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Nop58Q6DFW4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Nop58Q6DFW4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Nop58Q6DFW4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Nop58Q6DFW4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Nop58Q6DFW4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Nop58Q6DFW4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Nop58Q6DFW4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Nop58Q6DFW4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Nop58Q6DFW4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Nop58Q6DFW4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Nop58Q6DFW4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Nop58Q6DFW4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Nop58Q6DFW4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Nop58Q6DFW4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Nop58Q6DFW4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Nop58Q6DFW4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Nop58Q6DFW4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Nop58Q6DFW4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Nop58Q6DFW4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Nop58Q6DFW4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Nop58Q6DFW4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Nop58Q6DFW4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Nop58Q6DFW4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Nop58Q6DFW4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Nop58Q6DFW4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Nop58Q6DFW4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Nop58Q6DFW4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Nop58Q6DFW4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Nop58Q6DFW4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Nop58Q6DFW4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Nop58Q6DFW4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Nop58Q6DFW4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Nop58Q6DFW4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Nop58Q6DFW4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Nop58Q6DFW4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Nop58Q6DFW4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Nop58Q6DFW4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Nop58Q6DFW4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Nop58Q6DFW4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Nop58Q6DFW4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Nop58Q6DFW4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Nop58Q6DFW4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Nop58Q6DFW4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Nop58Q6DFW4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Nop58Q6DFW4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Nop58Q6DFW4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Nop58Q6DFW4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Nop58Q6DFW4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nop58Q6DFW4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nop58Q6DFW4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nop58Q6DFW4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Nop58Q6DFW4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Nop58Q6DFW4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Nop58Q6DFW4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Nop58Q6DFW4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Nop58Q6DFW4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Nop58Q6DFW4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Nop58Q6DFW4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Nop58Q6DFW4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Nop58Q6DFW4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Nop58Q6DFW4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Nop58Q6DFW4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Nop58Q6DFW4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Nop58Q6DFW4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Nop58Q6DFW4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Nop58Q6DFW4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Nop58Q6DFW4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Nop58Q6DFW4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Nop58Q6DFW4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Nop58Q6DFW4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Nop58Q6DFW4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Nop58Q6DFW4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Nop58Q6DFW4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Nop58Q6DFW4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Nop58Q6DFW4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Nop58Q6DFW4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Nop58Q6DFW4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Nop58Q6DFW4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Nop58Q6DFW4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Nop58Q6DFW4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Nop58Q6DFW4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Nop58Q6DFW4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Nop58Q6DFW4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Nop58Q6DFW4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Nop58Q6DFW4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Nop58Q6DFW4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Nop58Q6DFW4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Nop58Q6DFW4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Nop58Q6DFW4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Nop58Q6DFW4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Nop58Q6DFW4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Nop58Q6DFW4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Nop58Q6DFW4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Nop58Q6DFW4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms