Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep290Q6A078 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cep290Q6A078 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Cep290Q6A078 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cep290Q6A078 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cep290Q6A078 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cep290Q6A078 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cep290Q6A078 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cep290Q6A078 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cep290Q6A078 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cep290Q6A078 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cep290Q6A078 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cep290Q6A078 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cep290Q6A078 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cep290Q6A078 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cep290Q6A078 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cep290Q6A078 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cep290Q6A078 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cep290Q6A078 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cep290Q6A078 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cep290Q6A078 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cep290Q6A078 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cep290Q6A078 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cep290Q6A078 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cep290Q6A078 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cep290Q6A078 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cep290Q6A078 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cep290Q6A078 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cep290Q6A078 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cep290Q6A078 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cep290Q6A078 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cep290Q6A078 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cep290Q6A078 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cep290Q6A078 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cep290Q6A078 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cep290Q6A078 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cep290Q6A078 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cep290Q6A078 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cep290Q6A078 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cep290Q6A078 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cep290Q6A078 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cep290Q6A078 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cep290Q6A078 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cep290Q6A078 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep290Q6A078 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep290Q6A078 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep290Q6A078 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cep290Q6A078 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cep290Q6A078 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cep290Q6A078 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cep290Q6A078 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cep290Q6A078 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cep290Q6A078 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cep290Q6A078 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cep290Q6A078 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cep290Q6A078 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cep290Q6A078 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cep290Q6A078 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep290Q6A078 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep290Q6A078 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep290Q6A078 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep290Q6A078 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep290Q6A078 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cep290Q6A078 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cep290Q6A078 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cep290Q6A078 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cep290Q6A078 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cep290Q6A078 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cep290Q6A078 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cep290Q6A078 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cep290Q6A078 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cep290Q6A078 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cep290Q6A078 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cep290Q6A078 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cep290Q6A078 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cep290Q6A078 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cep290Q6A078 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cep290Q6A078 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cep290Q6A078 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cep290Q6A078 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cep290Q6A078 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cep290Q6A078 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cep290Q6A078 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cep290Q6A078 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cep290Q6A078 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cep290Q6A078 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cep290Q6A078 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cep290Q6A078 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cep290Q6A078 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cep290Q6A078 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cep290Q6A078 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cep290Q6A078 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cep290Q6A078 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cep290Q6A078 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cep290Q6A078 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cep290Q6A078 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cep290Q6A078 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cep290Q6A078 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cep290Q6A078 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cep290Q6A078 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
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