Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmcc1Q69ZZ6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmcc1Q69ZZ6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmcc1Q69ZZ6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmcc1Q69ZZ6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmcc1Q69ZZ6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmcc1Q69ZZ6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmcc1Q69ZZ6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmcc1Q69ZZ6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tmcc1Q69ZZ6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tmcc1Q69ZZ6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmcc1Q69ZZ6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmcc1Q69ZZ6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmcc1Q69ZZ6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmcc1Q69ZZ6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmcc1Q69ZZ6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmcc1Q69ZZ6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmcc1Q69ZZ6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmcc1Q69ZZ6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmcc1Q69ZZ6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmcc1Q69ZZ6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmcc1Q69ZZ6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmcc1Q69ZZ6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmcc1Q69ZZ6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmcc1Q69ZZ6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmcc1Q69ZZ6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmcc1Q69ZZ6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmcc1Q69ZZ6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmcc1Q69ZZ6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmcc1Q69ZZ6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmcc1Q69ZZ6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmcc1Q69ZZ6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmcc1Q69ZZ6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmcc1Q69ZZ6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmcc1Q69ZZ6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmcc1Q69ZZ6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmcc1Q69ZZ6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmcc1Q69ZZ6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmcc1Q69ZZ6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmcc1Q69ZZ6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmcc1Q69ZZ6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmcc1Q69ZZ6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmcc1Q69ZZ6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmcc1Q69ZZ6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmcc1Q69ZZ6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmcc1Q69ZZ6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmcc1Q69ZZ6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmcc1Q69ZZ6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmcc1Q69ZZ6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmcc1Q69ZZ6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmcc1Q69ZZ6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmcc1Q69ZZ6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmcc1Q69ZZ6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmcc1Q69ZZ6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmcc1Q69ZZ6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmcc1Q69ZZ6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmcc1Q69ZZ6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmcc1Q69ZZ6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmcc1Q69ZZ6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmcc1Q69ZZ6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmcc1Q69ZZ6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmcc1Q69ZZ6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmcc1Q69ZZ6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmcc1Q69ZZ6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmcc1Q69ZZ6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmcc1Q69ZZ6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmcc1Q69ZZ6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmcc1Q69ZZ6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmcc1Q69ZZ6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmcc1Q69ZZ6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmcc1Q69ZZ6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmcc1Q69ZZ6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmcc1Q69ZZ6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmcc1Q69ZZ6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmcc1Q69ZZ6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmcc1Q69ZZ6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmcc1Q69ZZ6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmcc1Q69ZZ6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmcc1Q69ZZ6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmcc1Q69ZZ6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmcc1Q69ZZ6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmcc1Q69ZZ6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmcc1Q69ZZ6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmcc1Q69ZZ6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmcc1Q69ZZ6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmcc1Q69ZZ6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmcc1Q69ZZ6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmcc1Q69ZZ6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmcc1Q69ZZ6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmcc1Q69ZZ6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmcc1Q69ZZ6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmcc1Q69ZZ6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmcc1Q69ZZ6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmcc1Q69ZZ6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms