Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pdzrn3Q69ZS0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pdzrn3Q69ZS0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pdzrn3Q69ZS0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pdzrn3Q69ZS0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pdzrn3Q69ZS0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pdzrn3Q69ZS0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pdzrn3Q69ZS0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pdzrn3Q69ZS0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pdzrn3Q69ZS0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pdzrn3Q69ZS0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pdzrn3Q69ZS0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pdzrn3Q69ZS0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pdzrn3Q69ZS0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pdzrn3Q69ZS0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pdzrn3Q69ZS0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pdzrn3Q69ZS0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pdzrn3Q69ZS0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pdzrn3Q69ZS0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pdzrn3Q69ZS0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pdzrn3Q69ZS0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pdzrn3Q69ZS0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pdzrn3Q69ZS0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Pdzrn3Q69ZS0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pdzrn3Q69ZS0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pdzrn3Q69ZS0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pdzrn3Q69ZS0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pdzrn3Q69ZS0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pdzrn3Q69ZS0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pdzrn3Q69ZS0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pdzrn3Q69ZS0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pdzrn3Q69ZS0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pdzrn3Q69ZS0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Pdzrn3Q69ZS0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pdzrn3Q69ZS0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Pdzrn3Q69ZS0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pdzrn3Q69ZS0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pdzrn3Q69ZS0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pdzrn3Q69ZS0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pdzrn3Q69ZS0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pdzrn3Q69ZS0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pdzrn3Q69ZS0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pdzrn3Q69ZS0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pdzrn3Q69ZS0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pdzrn3Q69ZS0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pdzrn3Q69ZS0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pdzrn3Q69ZS0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pdzrn3Q69ZS0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pdzrn3Q69ZS0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pdzrn3Q69ZS0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Pdzrn3Q69ZS0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Pdzrn3Q69ZS0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pdzrn3Q69ZS0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Pdzrn3Q69ZS0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Pdzrn3Q69ZS0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pdzrn3Q69ZS0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Pdzrn3Q69ZS0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pdzrn3Q69ZS0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pdzrn3Q69ZS0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pdzrn3Q69ZS0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pdzrn3Q69ZS0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Pdzrn3Q69ZS0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms