Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZP3

Pnkd, Probable hydrolase PNKD, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkdQ69ZP3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PnkdQ69ZP3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PnkdQ69ZP3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PnkdQ69ZP3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PnkdQ69ZP3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PnkdQ69ZP3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PnkdQ69ZP3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PnkdQ69ZP3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PnkdQ69ZP3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PnkdQ69ZP3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms