Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Jmjd1cQ69ZK6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Jmjd1cQ69ZK6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Jmjd1cQ69ZK6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Jmjd1cQ69ZK6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Jmjd1cQ69ZK6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Jmjd1cQ69ZK6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Jmjd1cQ69ZK6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Jmjd1cQ69ZK6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Jmjd1cQ69ZK6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Jmjd1cQ69ZK6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Jmjd1cQ69ZK6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Jmjd1cQ69ZK6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Jmjd1cQ69ZK6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Jmjd1cQ69ZK6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Jmjd1cQ69ZK6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Jmjd1cQ69ZK6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Jmjd1cQ69ZK6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Jmjd1cQ69ZK6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Jmjd1cQ69ZK6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Jmjd1cQ69ZK6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Jmjd1cQ69ZK6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Jmjd1cQ69ZK6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Jmjd1cQ69ZK6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Jmjd1cQ69ZK6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Jmjd1cQ69ZK6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Jmjd1cQ69ZK6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Jmjd1cQ69ZK6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Jmjd1cQ69ZK6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Jmjd1cQ69ZK6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Jmjd1cQ69ZK6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Jmjd1cQ69ZK6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Jmjd1cQ69ZK6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Jmjd1cQ69ZK6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Jmjd1cQ69ZK6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Jmjd1cQ69ZK6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Jmjd1cQ69ZK6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Jmjd1cQ69ZK6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Jmjd1cQ69ZK6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Jmjd1cQ69ZK6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Jmjd1cQ69ZK6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Jmjd1cQ69ZK6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Jmjd1cQ69ZK6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Jmjd1cQ69ZK6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Jmjd1cQ69ZK6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Jmjd1cQ69ZK6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Jmjd1cQ69ZK6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Jmjd1cQ69ZK6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Jmjd1cQ69ZK6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Jmjd1cQ69ZK6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Jmjd1cQ69ZK6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Jmjd1cQ69ZK6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Jmjd1cQ69ZK6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Jmjd1cQ69ZK6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Jmjd1cQ69ZK6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Jmjd1cQ69ZK6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Jmjd1cQ69ZK6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Jmjd1cQ69ZK6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Jmjd1cQ69ZK6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Jmjd1cQ69ZK6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Jmjd1cQ69ZK6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Jmjd1cQ69ZK6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Jmjd1cQ69ZK6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Jmjd1cQ69ZK6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Jmjd1cQ69ZK6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Jmjd1cQ69ZK6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Jmjd1cQ69ZK6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Jmjd1cQ69ZK6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Jmjd1cQ69ZK6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Jmjd1cQ69ZK6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Jmjd1cQ69ZK6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Jmjd1cQ69ZK6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Jmjd1cQ69ZK6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Jmjd1cQ69ZK6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Jmjd1cQ69ZK6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Jmjd1cQ69ZK6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Jmjd1cQ69ZK6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Jmjd1cQ69ZK6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Jmjd1cQ69ZK6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Jmjd1cQ69ZK6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Jmjd1cQ69ZK6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Jmjd1cQ69ZK6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Jmjd1cQ69ZK6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Jmjd1cQ69ZK6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Jmjd1cQ69ZK6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Jmjd1cQ69ZK6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Jmjd1cQ69ZK6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Jmjd1cQ69ZK6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Jmjd1cQ69ZK6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Jmjd1cQ69ZK6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Jmjd1cQ69ZK6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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