Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zcchc2Q69ZB8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zcchc2Q69ZB8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zcchc2Q69ZB8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zcchc2Q69ZB8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zcchc2Q69ZB8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zcchc2Q69ZB8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zcchc2Q69ZB8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zcchc2Q69ZB8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zcchc2Q69ZB8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zcchc2Q69ZB8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zcchc2Q69ZB8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Zcchc2Q69ZB8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zcchc2Q69ZB8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zcchc2Q69ZB8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zcchc2Q69ZB8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zcchc2Q69ZB8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zcchc2Q69ZB8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zcchc2Q69ZB8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zcchc2Q69ZB8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zcchc2Q69ZB8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Zcchc2Q69ZB8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zcchc2Q69ZB8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zcchc2Q69ZB8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Zcchc2Q69ZB8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zcchc2Q69ZB8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zcchc2Q69ZB8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zcchc2Q69ZB8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zcchc2Q69ZB8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zcchc2Q69ZB8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zcchc2Q69ZB8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zcchc2Q69ZB8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zcchc2Q69ZB8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Zcchc2Q69ZB8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Zcchc2Q69ZB8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zcchc2Q69ZB8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Zcchc2Q69ZB8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zcchc2Q69ZB8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zcchc2Q69ZB8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Zcchc2Q69ZB8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zcchc2Q69ZB8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zcchc2Q69ZB8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zcchc2Q69ZB8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zcchc2Q69ZB8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zcchc2Q69ZB8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zcchc2Q69ZB8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zcchc2Q69ZB8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zcchc2Q69ZB8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zcchc2Q69ZB8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zcchc2Q69ZB8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Zcchc2Q69ZB8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zcchc2Q69ZB8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zcchc2Q69ZB8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zcchc2Q69ZB8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zcchc2Q69ZB8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zcchc2Q69ZB8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zcchc2Q69ZB8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zcchc2Q69ZB8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zcchc2Q69ZB8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zcchc2Q69ZB8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zcchc2Q69ZB8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zcchc2Q69ZB8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zcchc2Q69ZB8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zcchc2Q69ZB8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zcchc2Q69ZB8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zcchc2Q69ZB8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zcchc2Q69ZB8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zcchc2Q69ZB8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zcchc2Q69ZB8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zcchc2Q69ZB8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zcchc2Q69ZB8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zcchc2Q69ZB8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Zcchc2Q69ZB8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Zcchc2Q69ZB8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Zcchc2Q69ZB8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zcchc2Q69ZB8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zcchc2Q69ZB8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zcchc2Q69ZB8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zcchc2Q69ZB8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zcchc2Q69ZB8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zcchc2Q69ZB8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Zcchc2Q69ZB8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zcchc2Q69ZB8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zcchc2Q69ZB8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zcchc2Q69ZB8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zcchc2Q69ZB8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zcchc2Q69ZB8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zcchc2Q69ZB8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zcchc2Q69ZB8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zcchc2Q69ZB8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zcchc2Q69ZB8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Zcchc2Q69ZB8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zcchc2Q69ZB8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zcchc2Q69ZB8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zcchc2Q69ZB8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zcchc2Q69ZB8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zcchc2Q69ZB8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zcchc2Q69ZB8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zcchc2Q69ZB8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zcchc2Q69ZB8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 284.2 ms