Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrcc1Q69ZB0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrcc1Q69ZB0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrcc1Q69ZB0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrcc1Q69ZB0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrcc1Q69ZB0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrcc1Q69ZB0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrcc1Q69ZB0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrcc1Q69ZB0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrcc1Q69ZB0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrcc1Q69ZB0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrrcc1Q69ZB0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lrrcc1Q69ZB0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrcc1Q69ZB0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrcc1Q69ZB0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms