Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkp4Q68FH0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkp4Q68FH0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkp4Q68FH0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkp4Q68FH0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkp4Q68FH0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkp4Q68FH0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkp4Q68FH0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkp4Q68FH0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp4Q68FH0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp4Q68FH0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp4Q68FH0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp4Q68FH0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkp4Q68FH0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkp4Q68FH0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkp4Q68FH0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkp4Q68FH0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkp4Q68FH0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkp4Q68FH0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkp4Q68FH0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkp4Q68FH0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkp4Q68FH0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkp4Q68FH0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkp4Q68FH0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkp4Q68FH0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp4Q68FH0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp4Q68FH0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp4Q68FH0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp4Q68FH0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp4Q68FH0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp4Q68FH0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp4Q68FH0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp4Q68FH0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkp4Q68FH0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkp4Q68FH0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkp4Q68FH0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkp4Q68FH0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pkp4Q68FH0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pkp4Q68FH0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkp4Q68FH0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkp4Q68FH0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkp4Q68FH0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkp4Q68FH0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkp4Q68FH0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp4Q68FH0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp4Q68FH0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp4Q68FH0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp4Q68FH0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp4Q68FH0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp4Q68FH0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp4Q68FH0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp4Q68FH0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp4Q68FH0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp4Q68FH0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp4Q68FH0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp4Q68FH0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp4Q68FH0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp4Q68FH0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp4Q68FH0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp4Q68FH0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp4Q68FH0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp4Q68FH0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp4Q68FH0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp4Q68FH0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp4Q68FH0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp4Q68FH0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp4Q68FH0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp4Q68FH0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp4Q68FH0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkp4Q68FH0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkp4Q68FH0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkp4Q68FH0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkp4Q68FH0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pkp4Q68FH0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkp4Q68FH0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pkp4Q68FH0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkp4Q68FH0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkp4Q68FH0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkp4Q68FH0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkp4Q68FH0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkp4Q68FH0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkp4Q68FH0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkp4Q68FH0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkp4Q68FH0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkp4Q68FH0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkp4Q68FH0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkp4Q68FH0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pkp4Q68FH0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Pkp4Q68FH0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pkp4Q68FH0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pkp4Q68FH0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pkp4Q68FH0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pkp4Q68FH0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp4Q68FH0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp4Q68FH0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp4Q68FH0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp4Q68FH0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkp4Q68FH0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkp4Q68FH0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pkp4Q68FH0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.28■■□□□ 1
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