Protein–RNA interactions for Protein: Q68ED3

Papd5, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd5Q68ED3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Papd5Q68ED3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Papd5Q68ED3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Papd5Q68ED3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Papd5Q68ED3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Papd5Q68ED3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Papd5Q68ED3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Papd5Q68ED3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Papd5Q68ED3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Papd5Q68ED3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Papd5Q68ED3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Papd5Q68ED3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Papd5Q68ED3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Papd5Q68ED3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Papd5Q68ED3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Papd5Q68ED3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Papd5Q68ED3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Papd5Q68ED3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Papd5Q68ED3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Papd5Q68ED3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Papd5Q68ED3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Papd5Q68ED3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Papd5Q68ED3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Papd5Q68ED3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Papd5Q68ED3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Papd5Q68ED3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Papd5Q68ED3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Papd5Q68ED3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Papd5Q68ED3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Papd5Q68ED3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Papd5Q68ED3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Papd5Q68ED3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Papd5Q68ED3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Papd5Q68ED3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Papd5Q68ED3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Papd5Q68ED3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Papd5Q68ED3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Papd5Q68ED3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Papd5Q68ED3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Papd5Q68ED3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Papd5Q68ED3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Papd5Q68ED3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Papd5Q68ED3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Papd5Q68ED3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Papd5Q68ED3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Papd5Q68ED3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Papd5Q68ED3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Papd5Q68ED3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Papd5Q68ED3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Papd5Q68ED3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Papd5Q68ED3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Papd5Q68ED3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Papd5Q68ED3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Papd5Q68ED3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Papd5Q68ED3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Papd5Q68ED3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Papd5Q68ED3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Papd5Q68ED3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Papd5Q68ED3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Papd5Q68ED3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Papd5Q68ED3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Papd5Q68ED3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Papd5Q68ED3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Papd5Q68ED3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Papd5Q68ED3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Papd5Q68ED3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Papd5Q68ED3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Papd5Q68ED3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Papd5Q68ED3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Papd5Q68ED3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Papd5Q68ED3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Papd5Q68ED3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Papd5Q68ED3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Papd5Q68ED3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Papd5Q68ED3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Papd5Q68ED3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Papd5Q68ED3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Papd5Q68ED3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Papd5Q68ED3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Papd5Q68ED3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Papd5Q68ED3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Papd5Q68ED3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Papd5Q68ED3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Papd5Q68ED3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Papd5Q68ED3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Papd5Q68ED3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Papd5Q68ED3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Papd5Q68ED3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Papd5Q68ED3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Papd5Q68ED3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Papd5Q68ED3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Papd5Q68ED3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Papd5Q68ED3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Papd5Q68ED3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Papd5Q68ED3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Papd5Q68ED3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Papd5Q68ED3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Papd5Q68ED3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Papd5Q68ED3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Papd5Q68ED3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms