Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Surf4Q64310 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Surf4Q64310 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Surf4Q64310 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Surf4Q64310 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Surf4Q64310 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Surf4Q64310 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Surf4Q64310 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Surf4Q64310 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Surf4Q64310 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Surf4Q64310 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Surf4Q64310 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Surf4Q64310 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Surf4Q64310 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Surf4Q64310 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Surf4Q64310 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Surf4Q64310 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Surf4Q64310 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Surf4Q64310 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Surf4Q64310 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Surf4Q64310 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Surf4Q64310 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Surf4Q64310 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Surf4Q64310 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Surf4Q64310 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Surf4Q64310 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Surf4Q64310 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Surf4Q64310 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Surf4Q64310 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Surf4Q64310 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Surf4Q64310 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Surf4Q64310 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Surf4Q64310 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Surf4Q64310 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Surf4Q64310 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Surf4Q64310 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Surf4Q64310 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Surf4Q64310 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Surf4Q64310 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Surf4Q64310 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Surf4Q64310 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Surf4Q64310 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Surf4Q64310 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Surf4Q64310 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms