Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt12Q64291 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt12Q64291 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt12Q64291 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt12Q64291 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt12Q64291 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt12Q64291 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Krt12Q64291 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt12Q64291 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt12Q64291 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt12Q64291 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt12Q64291 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt12Q64291 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt12Q64291 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt12Q64291 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt12Q64291 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt12Q64291 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt12Q64291 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt12Q64291 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt12Q64291 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt12Q64291 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt12Q64291 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt12Q64291 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt12Q64291 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt12Q64291 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt12Q64291 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt12Q64291 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt12Q64291 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt12Q64291 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt12Q64291 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt12Q64291 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt12Q64291 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt12Q64291 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt12Q64291 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt12Q64291 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt12Q64291 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt12Q64291 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt12Q64291 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt12Q64291 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt12Q64291 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt12Q64291 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt12Q64291 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt12Q64291 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt12Q64291 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt12Q64291 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt12Q64291 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt12Q64291 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt12Q64291 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt12Q64291 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt12Q64291 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt12Q64291 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt12Q64291 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt12Q64291 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt12Q64291 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt12Q64291 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt12Q64291 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms