Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nhlh2Q64221 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nhlh2Q64221 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nhlh2Q64221 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nhlh2Q64221 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nhlh2Q64221 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nhlh2Q64221 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nhlh2Q64221 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nhlh2Q64221 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nhlh2Q64221 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nhlh2Q64221 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nhlh2Q64221 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nhlh2Q64221 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nhlh2Q64221 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nhlh2Q64221 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nhlh2Q64221 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nhlh2Q64221 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nhlh2Q64221 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nhlh2Q64221 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nhlh2Q64221 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nhlh2Q64221 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nhlh2Q64221 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nhlh2Q64221 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nhlh2Q64221 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nhlh2Q64221 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nhlh2Q64221 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlh2Q64221 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlh2Q64221 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlh2Q64221 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlh2Q64221 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlh2Q64221 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlh2Q64221 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nhlh2Q64221 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nhlh2Q64221 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nhlh2Q64221 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nhlh2Q64221 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nhlh2Q64221 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nhlh2Q64221 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nhlh2Q64221 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlh2Q64221 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlh2Q64221 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlh2Q64221 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlh2Q64221 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlh2Q64221 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlh2Q64221 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlh2Q64221 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlh2Q64221 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlh2Q64221 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlh2Q64221 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlh2Q64221 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlh2Q64221 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlh2Q64221 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlh2Q64221 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlh2Q64221 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlh2Q64221 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlh2Q64221 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlh2Q64221 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlh2Q64221 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlh2Q64221 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlh2Q64221 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlh2Q64221 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlh2Q64221 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlh2Q64221 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlh2Q64221 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlh2Q64221 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlh2Q64221 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nhlh2Q64221 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nhlh2Q64221 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nhlh2Q64221 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nhlh2Q64221 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nhlh2Q64221 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nhlh2Q64221 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlh2Q64221 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlh2Q64221 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlh2Q64221 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nhlh2Q64221 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlh2Q64221 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlh2Q64221 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlh2Q64221 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlh2Q64221 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nhlh2Q64221 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.9 ms