Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zic2Q62520 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zic2Q62520 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zic2Q62520 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zic2Q62520 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zic2Q62520 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zic2Q62520 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zic2Q62520 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zic2Q62520 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zic2Q62520 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zic2Q62520 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zic2Q62520 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zic2Q62520 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zic2Q62520 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zic2Q62520 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zic2Q62520 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Zic2Q62520 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zic2Q62520 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zic2Q62520 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zic2Q62520 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zic2Q62520 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zic2Q62520 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zic2Q62520 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zic2Q62520 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zic2Q62520 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zic2Q62520 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zic2Q62520 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zic2Q62520 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zic2Q62520 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Zic2Q62520 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zic2Q62520 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zic2Q62520 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zic2Q62520 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zic2Q62520 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zic2Q62520 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zic2Q62520 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zic2Q62520 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zic2Q62520 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zic2Q62520 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zic2Q62520 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zic2Q62520 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zic2Q62520 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zic2Q62520 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zic2Q62520 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zic2Q62520 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zic2Q62520 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zic2Q62520 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zic2Q62520 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zic2Q62520 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Zic2Q62520 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zic2Q62520 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zic2Q62520 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Zic2Q62520 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zic2Q62520 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zic2Q62520 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Zic2Q62520 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Zic2Q62520 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zic2Q62520 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zic2Q62520 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Zic2Q62520 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms