Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lcn4Q62472 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lcn4Q62472 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lcn4Q62472 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lcn4Q62472 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lcn4Q62472 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lcn4Q62472 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Lcn4Q62472 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
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Lcn4Q62472 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lcn4Q62472 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lcn4Q62472 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lcn4Q62472 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lcn4Q62472 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lcn4Q62472 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lcn4Q62472 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lcn4Q62472 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lcn4Q62472 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lcn4Q62472 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lcn4Q62472 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lcn4Q62472 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lcn4Q62472 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Lcn4Q62472 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Lcn4Q62472 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lcn4Q62472 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lcn4Q62472 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lcn4Q62472 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lcn4Q62472 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lcn4Q62472 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lcn4Q62472 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lcn4Q62472 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lcn4Q62472 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lcn4Q62472 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lcn4Q62472 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lcn4Q62472 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Lcn4Q62472 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lcn4Q62472 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lcn4Q62472 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lcn4Q62472 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lcn4Q62472 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lcn4Q62472 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lcn4Q62472 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lcn4Q62472 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lcn4Q62472 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lcn4Q62472 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lcn4Q62472 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lcn4Q62472 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lcn4Q62472 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lcn4Q62472 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lcn4Q62472 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lcn4Q62472 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lcn4Q62472 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lcn4Q62472 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lcn4Q62472 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lcn4Q62472 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lcn4Q62472 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lcn4Q62472 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lcn4Q62472 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lcn4Q62472 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lcn4Q62472 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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