Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vil1Q62468 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vil1Q62468 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vil1Q62468 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vil1Q62468 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vil1Q62468 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vil1Q62468 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vil1Q62468 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vil1Q62468 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vil1Q62468 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vil1Q62468 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vil1Q62468 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Vil1Q62468 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vil1Q62468 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vil1Q62468 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vil1Q62468 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vil1Q62468 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vil1Q62468 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vil1Q62468 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vil1Q62468 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vil1Q62468 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vil1Q62468 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vil1Q62468 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vil1Q62468 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vil1Q62468 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vil1Q62468 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vil1Q62468 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vil1Q62468 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vil1Q62468 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vil1Q62468 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vil1Q62468 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vil1Q62468 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vil1Q62468 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vil1Q62468 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Vil1Q62468 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vil1Q62468 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vil1Q62468 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vil1Q62468 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vil1Q62468 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vil1Q62468 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vil1Q62468 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vil1Q62468 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Vil1Q62468 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vil1Q62468 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vil1Q62468 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vil1Q62468 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vil1Q62468 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vil1Q62468 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vil1Q62468 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vil1Q62468 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vil1Q62468 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Vil1Q62468 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vil1Q62468 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vil1Q62468 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vil1Q62468 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vil1Q62468 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vil1Q62468 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vil1Q62468 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vil1Q62468 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Vil1Q62468 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vil1Q62468 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vil1Q62468 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vil1Q62468 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vil1Q62468 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vil1Q62468 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vil1Q62468 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vil1Q62468 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vil1Q62468 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vil1Q62468 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vil1Q62468 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Vil1Q62468 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vil1Q62468 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vil1Q62468 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Vil1Q62468 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vil1Q62468 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vil1Q62468 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vil1Q62468 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vil1Q62468 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Vil1Q62468 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vil1Q62468 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vil1Q62468 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vil1Q62468 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Vil1Q62468 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vil1Q62468 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vil1Q62468 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vil1Q62468 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vil1Q62468 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vil1Q62468 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vil1Q62468 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vil1Q62468 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vil1Q62468 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vil1Q62468 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vil1Q62468 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vil1Q62468 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vil1Q62468 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vil1Q62468 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vil1Q62468 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vil1Q62468 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vil1Q62468 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vil1Q62468 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms