Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CcncQ62447 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CcncQ62447 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CcncQ62447 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CcncQ62447 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CcncQ62447 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CcncQ62447 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CcncQ62447 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CcncQ62447 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CcncQ62447 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CcncQ62447 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CcncQ62447 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CcncQ62447 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CcncQ62447 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CcncQ62447 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CcncQ62447 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CcncQ62447 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CcncQ62447 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CcncQ62447 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CcncQ62447 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CcncQ62447 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CcncQ62447 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CcncQ62447 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CcncQ62447 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CcncQ62447 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CcncQ62447 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CcncQ62447 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CcncQ62447 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CcncQ62447 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CcncQ62447 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CcncQ62447 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CcncQ62447 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CcncQ62447 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CcncQ62447 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CcncQ62447 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CcncQ62447 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CcncQ62447 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CcncQ62447 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CcncQ62447 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CcncQ62447 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CcncQ62447 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CcncQ62447 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CcncQ62447 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CcncQ62447 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CcncQ62447 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CcncQ62447 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CcncQ62447 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CcncQ62447 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CcncQ62447 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CcncQ62447 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CcncQ62447 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CcncQ62447 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CcncQ62447 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CcncQ62447 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CcncQ62447 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CcncQ62447 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CcncQ62447 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CcncQ62447 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CcncQ62447 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CcncQ62447 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CcncQ62447 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CcncQ62447 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CcncQ62447 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CcncQ62447 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CcncQ62447 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CcncQ62447 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CcncQ62447 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CcncQ62447 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CcncQ62447 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CcncQ62447 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CcncQ62447 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CcncQ62447 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CcncQ62447 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CcncQ62447 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CcncQ62447 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CcncQ62447 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CcncQ62447 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CcncQ62447 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CcncQ62447 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CcncQ62447 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CcncQ62447 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CcncQ62447 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CcncQ62447 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CcncQ62447 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CcncQ62447 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CcncQ62447 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CcncQ62447 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CcncQ62447 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CcncQ62447 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CcncQ62447 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CcncQ62447 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CcncQ62447 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CcncQ62447 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CcncQ62447 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CcncQ62447 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CcncQ62447 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CcncQ62447 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CcncQ62447 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CcncQ62447 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CcncQ62447 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms