Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sp4Q62445 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sp4Q62445 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sp4Q62445 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sp4Q62445 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sp4Q62445 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sp4Q62445 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sp4Q62445 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sp4Q62445 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sp4Q62445 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sp4Q62445 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sp4Q62445 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sp4Q62445 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sp4Q62445 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Sp4Q62445 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sp4Q62445 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Sp4Q62445 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sp4Q62445 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sp4Q62445 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sp4Q62445 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sp4Q62445 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sp4Q62445 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sp4Q62445 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sp4Q62445 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sp4Q62445 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sp4Q62445 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sp4Q62445 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sp4Q62445 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sp4Q62445 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sp4Q62445 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sp4Q62445 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sp4Q62445 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sp4Q62445 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sp4Q62445 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sp4Q62445 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Sp4Q62445 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sp4Q62445 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sp4Q62445 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sp4Q62445 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sp4Q62445 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sp4Q62445 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sp4Q62445 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sp4Q62445 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sp4Q62445 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sp4Q62445 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sp4Q62445 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Sp4Q62445 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sp4Q62445 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sp4Q62445 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sp4Q62445 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sp4Q62445 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sp4Q62445 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sp4Q62445 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sp4Q62445 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sp4Q62445 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sp4Q62445 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sp4Q62445 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Sp4Q62445 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sp4Q62445 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sp4Q62445 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sp4Q62445 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sp4Q62445 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sp4Q62445 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sp4Q62445 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sp4Q62445 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sp4Q62445 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sp4Q62445 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sp4Q62445 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sp4Q62445 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sp4Q62445 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Sp4Q62445 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sp4Q62445 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sp4Q62445 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sp4Q62445 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sp4Q62445 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sp4Q62445 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sp4Q62445 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sp4Q62445 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sp4Q62445 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Sp4Q62445 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Sp4Q62445 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sp4Q62445 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sp4Q62445 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sp4Q62445 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sp4Q62445 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sp4Q62445 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sp4Q62445 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sp4Q62445 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Sp4Q62445 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sp4Q62445 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sp4Q62445 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Sp4Q62445 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sp4Q62445 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sp4Q62445 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sp4Q62445 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sp4Q62445 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sp4Q62445 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sp4Q62445 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Sp4Q62445 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sp4Q62445 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms