Protein–RNA interactions for Protein: Q62433

Ndrg1, Protein NDRG1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg1Q62433 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndrg1Q62433 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndrg1Q62433 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndrg1Q62433 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndrg1Q62433 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndrg1Q62433 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndrg1Q62433 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndrg1Q62433 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndrg1Q62433 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndrg1Q62433 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndrg1Q62433 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndrg1Q62433 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndrg1Q62433 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndrg1Q62433 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndrg1Q62433 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndrg1Q62433 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndrg1Q62433 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndrg1Q62433 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndrg1Q62433 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndrg1Q62433 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndrg1Q62433 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndrg1Q62433 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndrg1Q62433 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndrg1Q62433 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndrg1Q62433 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndrg1Q62433 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ndrg1Q62433 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Ndrg1Q62433 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ndrg1Q62433 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndrg1Q62433 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ndrg1Q62433 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndrg1Q62433 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndrg1Q62433 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndrg1Q62433 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndrg1Q62433 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndrg1Q62433 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndrg1Q62433 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndrg1Q62433 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndrg1Q62433 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndrg1Q62433 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndrg1Q62433 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndrg1Q62433 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndrg1Q62433 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndrg1Q62433 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndrg1Q62433 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndrg1Q62433 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndrg1Q62433 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndrg1Q62433 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndrg1Q62433 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndrg1Q62433 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndrg1Q62433 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndrg1Q62433 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndrg1Q62433 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndrg1Q62433 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndrg1Q62433 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndrg1Q62433 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndrg1Q62433 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndrg1Q62433 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndrg1Q62433 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndrg1Q62433 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndrg1Q62433 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndrg1Q62433 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndrg1Q62433 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms