Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl12Q62401 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl12Q62401 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl12Q62401 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl12Q62401 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl12Q62401 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl12Q62401 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl12Q62401 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl12Q62401 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl12Q62401 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl12Q62401 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl12Q62401 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl12Q62401 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl12Q62401 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl12Q62401 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl12Q62401 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl12Q62401 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl12Q62401 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl12Q62401 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl12Q62401 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl12Q62401 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl12Q62401 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccl12Q62401 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccl12Q62401 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccl12Q62401 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl12Q62401 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms