Protein–RNA interactions for Protein: Q62398

Cnga2, Cyclic nucleotide-gated olfactory channel, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga2Q62398 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cnga2Q62398 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cnga2Q62398 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cnga2Q62398 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cnga2Q62398 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cnga2Q62398 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cnga2Q62398 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cnga2Q62398 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cnga2Q62398 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cnga2Q62398 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cnga2Q62398 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cnga2Q62398 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cnga2Q62398 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cnga2Q62398 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cnga2Q62398 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cnga2Q62398 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cnga2Q62398 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cnga2Q62398 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cnga2Q62398 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cnga2Q62398 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cnga2Q62398 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cnga2Q62398 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cnga2Q62398 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cnga2Q62398 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cnga2Q62398 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cnga2Q62398 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cnga2Q62398 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cnga2Q62398 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cnga2Q62398 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cnga2Q62398 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cnga2Q62398 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cnga2Q62398 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cnga2Q62398 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cnga2Q62398 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cnga2Q62398 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cnga2Q62398 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cnga2Q62398 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cnga2Q62398 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cnga2Q62398 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cnga2Q62398 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cnga2Q62398 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cnga2Q62398 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cnga2Q62398 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cnga2Q62398 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cnga2Q62398 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cnga2Q62398 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cnga2Q62398 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cnga2Q62398 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cnga2Q62398 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cnga2Q62398 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cnga2Q62398 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cnga2Q62398 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cnga2Q62398 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cnga2Q62398 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cnga2Q62398 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cnga2Q62398 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cnga2Q62398 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cnga2Q62398 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cnga2Q62398 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cnga2Q62398 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cnga2Q62398 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cnga2Q62398 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cnga2Q62398 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cnga2Q62398 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cnga2Q62398 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cnga2Q62398 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cnga2Q62398 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnga2Q62398 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnga2Q62398 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnga2Q62398 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnga2Q62398 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnga2Q62398 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnga2Q62398 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cnga2Q62398 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cnga2Q62398 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cnga2Q62398 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cnga2Q62398 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cnga2Q62398 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cnga2Q62398 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cnga2Q62398 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cnga2Q62398 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cnga2Q62398 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cnga2Q62398 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cnga2Q62398 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cnga2Q62398 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cnga2Q62398 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cnga2Q62398 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cnga2Q62398 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cnga2Q62398 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cnga2Q62398 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cnga2Q62398 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cnga2Q62398 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cnga2Q62398 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnga2Q62398 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnga2Q62398 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnga2Q62398 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnga2Q62398 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnga2Q62398 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnga2Q62398 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnga2Q62398 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms