Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SypQ62277 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SypQ62277 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SypQ62277 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SypQ62277 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SypQ62277 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SypQ62277 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SypQ62277 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SypQ62277 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SypQ62277 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SypQ62277 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SypQ62277 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SypQ62277 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SypQ62277 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SypQ62277 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SypQ62277 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SypQ62277 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SypQ62277 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SypQ62277 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SypQ62277 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SypQ62277 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SypQ62277 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SypQ62277 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SypQ62277 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SypQ62277 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SypQ62277 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SypQ62277 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SypQ62277 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SypQ62277 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SypQ62277 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SypQ62277 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SypQ62277 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
SypQ62277 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SypQ62277 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SypQ62277 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SypQ62277 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SypQ62277 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SypQ62277 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SypQ62277 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SypQ62277 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SypQ62277 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SypQ62277 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SypQ62277 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SypQ62277 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SypQ62277 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SypQ62277 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SypQ62277 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SypQ62277 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SypQ62277 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SypQ62277 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SypQ62277 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SypQ62277 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SypQ62277 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SypQ62277 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SypQ62277 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SypQ62277 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SypQ62277 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SypQ62277 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SypQ62277 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SypQ62277 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SypQ62277 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SypQ62277 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SypQ62277 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SypQ62277 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SypQ62277 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SypQ62277 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SypQ62277 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SypQ62277 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SypQ62277 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SypQ62277 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SypQ62277 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SypQ62277 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SypQ62277 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SypQ62277 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SypQ62277 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SypQ62277 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SypQ62277 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SypQ62277 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SypQ62277 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SypQ62277 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SypQ62277 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SypQ62277 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SypQ62277 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SypQ62277 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SypQ62277 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SypQ62277 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SypQ62277 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SypQ62277 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SypQ62277 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SypQ62277 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SypQ62277 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SypQ62277 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SypQ62277 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SypQ62277 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SypQ62277 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SypQ62277 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SypQ62277 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SypQ62277 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SypQ62277 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SypQ62277 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms