Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Six2Q62232 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Six2Q62232 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Six2Q62232 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Six2Q62232 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Six2Q62232 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Six2Q62232 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Six2Q62232 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Six2Q62232 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Six2Q62232 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Six2Q62232 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Six2Q62232 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Six2Q62232 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Six2Q62232 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Six2Q62232 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Six2Q62232 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Six2Q62232 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Six2Q62232 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Six2Q62232 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Six2Q62232 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Six2Q62232 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Six2Q62232 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Six2Q62232 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Six2Q62232 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Six2Q62232 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Six2Q62232 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Six2Q62232 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Six2Q62232 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Six2Q62232 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Six2Q62232 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Six2Q62232 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Six2Q62232 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Six2Q62232 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Six2Q62232 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Six2Q62232 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Six2Q62232 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Six2Q62232 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Six2Q62232 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Six2Q62232 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Six2Q62232 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Six2Q62232 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Six2Q62232 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Six2Q62232 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Six2Q62232 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Six2Q62232 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Six2Q62232 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Six2Q62232 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Six2Q62232 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Six2Q62232 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Six2Q62232 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Six2Q62232 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Six2Q62232 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Six2Q62232 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Six2Q62232 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Six2Q62232 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Six2Q62232 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Six2Q62232 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Six2Q62232 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Six2Q62232 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Six2Q62232 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Six2Q62232 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Six2Q62232 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Six2Q62232 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Six2Q62232 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Six2Q62232 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Six2Q62232 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Six2Q62232 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Six2Q62232 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Six2Q62232 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Six2Q62232 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Six2Q62232 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Six2Q62232 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Six2Q62232 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Six2Q62232 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Six2Q62232 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Six2Q62232 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Six2Q62232 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Six2Q62232 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Six2Q62232 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Six2Q62232 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Six2Q62232 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Six2Q62232 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Six2Q62232 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Six2Q62232 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Six2Q62232 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Six2Q62232 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Six2Q62232 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Six2Q62232 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Six2Q62232 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Six2Q62232 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Six2Q62232 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Six2Q62232 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Six2Q62232 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Six2Q62232 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Six2Q62232 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Six2Q62232 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Six2Q62232 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Six2Q62232 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Six2Q62232 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Six2Q62232 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms