Protein–RNA interactions for Protein: Q62179

Sema4b, Semaphorin-4B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4bQ62179 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema4bQ62179 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema4bQ62179 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema4bQ62179 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema4bQ62179 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema4bQ62179 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sema4bQ62179 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sema4bQ62179 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema4bQ62179 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema4bQ62179 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema4bQ62179 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema4bQ62179 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sema4bQ62179 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sema4bQ62179 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sema4bQ62179 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sema4bQ62179 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sema4bQ62179 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sema4bQ62179 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sema4bQ62179 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sema4bQ62179 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sema4bQ62179 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema4bQ62179 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema4bQ62179 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema4bQ62179 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema4bQ62179 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sema4bQ62179 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Sema4bQ62179 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema4bQ62179 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema4bQ62179 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema4bQ62179 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema4bQ62179 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema4bQ62179 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema4bQ62179 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema4bQ62179 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema4bQ62179 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema4bQ62179 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema4bQ62179 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema4bQ62179 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema4bQ62179 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema4bQ62179 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema4bQ62179 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema4bQ62179 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema4bQ62179 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema4bQ62179 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema4bQ62179 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema4bQ62179 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema4bQ62179 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema4bQ62179 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sema4bQ62179 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sema4bQ62179 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sema4bQ62179 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sema4bQ62179 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema4bQ62179 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema4bQ62179 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema4bQ62179 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema4bQ62179 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema4bQ62179 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema4bQ62179 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema4bQ62179 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema4bQ62179 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema4bQ62179 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema4bQ62179 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema4bQ62179 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sema4bQ62179 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sema4bQ62179 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sema4bQ62179 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema4bQ62179 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema4bQ62179 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema4bQ62179 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sema4bQ62179 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sema4bQ62179 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sema4bQ62179 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema4bQ62179 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema4bQ62179 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema4bQ62179 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema4bQ62179 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema4bQ62179 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema4bQ62179 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema4bQ62179 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema4bQ62179 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema4bQ62179 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema4bQ62179 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema4bQ62179 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema4bQ62179 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema4bQ62179 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema4bQ62179 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema4bQ62179 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema4bQ62179 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema4bQ62179 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema4bQ62179 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema4bQ62179 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema4bQ62179 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema4bQ62179 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema4bQ62179 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sema4bQ62179 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema4bQ62179 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema4bQ62179 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema4bQ62179 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema4bQ62179 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema4bQ62179 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms