Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema4aQ62178 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema4aQ62178 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema4aQ62178 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema4aQ62178 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema4aQ62178 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema4aQ62178 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema4aQ62178 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema4aQ62178 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema4aQ62178 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema4aQ62178 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema4aQ62178 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema4aQ62178 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema4aQ62178 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema4aQ62178 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema4aQ62178 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema4aQ62178 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema4aQ62178 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema4aQ62178 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema4aQ62178 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema4aQ62178 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema4aQ62178 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema4aQ62178 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema4aQ62178 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema4aQ62178 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema4aQ62178 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema4aQ62178 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sema4aQ62178 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema4aQ62178 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema4aQ62178 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema4aQ62178 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema4aQ62178 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema4aQ62178 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema4aQ62178 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema4aQ62178 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema4aQ62178 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema4aQ62178 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema4aQ62178 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema4aQ62178 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema4aQ62178 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema4aQ62178 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema4aQ62178 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema4aQ62178 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema4aQ62178 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema4aQ62178 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema4aQ62178 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema4aQ62178 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema4aQ62178 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema4aQ62178 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema4aQ62178 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema4aQ62178 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema4aQ62178 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema4aQ62178 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema4aQ62178 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema4aQ62178 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema4aQ62178 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema4aQ62178 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema4aQ62178 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema4aQ62178 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema4aQ62178 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema4aQ62178 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema4aQ62178 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema4aQ62178 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema4aQ62178 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema4aQ62178 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema4aQ62178 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema4aQ62178 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema4aQ62178 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema4aQ62178 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema4aQ62178 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema4aQ62178 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema4aQ62178 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema4aQ62178 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema4aQ62178 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema4aQ62178 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema4aQ62178 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema4aQ62178 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sema4aQ62178 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema4aQ62178 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema4aQ62178 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sema4aQ62178 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema4aQ62178 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema4aQ62178 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sema4aQ62178 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema4aQ62178 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema4aQ62178 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema4aQ62178 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema4aQ62178 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema4aQ62178 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema4aQ62178 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema4aQ62178 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema4aQ62178 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema4aQ62178 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema4aQ62178 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sema4aQ62178 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema4aQ62178 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema4aQ62178 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema4aQ62178 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema4aQ62178 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema4aQ62178 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms