Protein–RNA interactions for Protein: Q62167

Ddx3x, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx3xQ62167 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx3xQ62167 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx3xQ62167 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ddx3xQ62167 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx3xQ62167 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx3xQ62167 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx3xQ62167 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx3xQ62167 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx3xQ62167 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx3xQ62167 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx3xQ62167 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx3xQ62167 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx3xQ62167 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx3xQ62167 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx3xQ62167 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx3xQ62167 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx3xQ62167 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx3xQ62167 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx3xQ62167 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx3xQ62167 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx3xQ62167 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx3xQ62167 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx3xQ62167 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx3xQ62167 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx3xQ62167 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx3xQ62167 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx3xQ62167 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx3xQ62167 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx3xQ62167 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx3xQ62167 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx3xQ62167 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx3xQ62167 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx3xQ62167 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx3xQ62167 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx3xQ62167 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx3xQ62167 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx3xQ62167 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx3xQ62167 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx3xQ62167 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx3xQ62167 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx3xQ62167 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx3xQ62167 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx3xQ62167 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx3xQ62167 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx3xQ62167 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddx3xQ62167 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddx3xQ62167 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddx3xQ62167 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddx3xQ62167 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddx3xQ62167 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddx3xQ62167 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddx3xQ62167 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddx3xQ62167 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddx3xQ62167 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddx3xQ62167 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddx3xQ62167 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ddx3xQ62167 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddx3xQ62167 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddx3xQ62167 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddx3xQ62167 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddx3xQ62167 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddx3xQ62167 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddx3xQ62167 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx3xQ62167 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx3xQ62167 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddx3xQ62167 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddx3xQ62167 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddx3xQ62167 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddx3xQ62167 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddx3xQ62167 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddx3xQ62167 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddx3xQ62167 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx3xQ62167 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx3xQ62167 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx3xQ62167 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx3xQ62167 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx3xQ62167 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx3xQ62167 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx3xQ62167 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ddx3xQ62167 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ddx3xQ62167 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ddx3xQ62167 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ddx3xQ62167 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ddx3xQ62167 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ddx3xQ62167 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ddx3xQ62167 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddx3xQ62167 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddx3xQ62167 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddx3xQ62167 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddx3xQ62167 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddx3xQ62167 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddx3xQ62167 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddx3xQ62167 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddx3xQ62167 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddx3xQ62167 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ddx3xQ62167 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ddx3xQ62167 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ddx3xQ62167 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ddx3xQ62167 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ddx3xQ62167 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 521.8 ms