Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PrkciQ62074 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PrkciQ62074 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrkciQ62074 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkciQ62074 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkciQ62074 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkciQ62074 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkciQ62074 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkciQ62074 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrkciQ62074 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrkciQ62074 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PrkciQ62074 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PrkciQ62074 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkciQ62074 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkciQ62074 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkciQ62074 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkciQ62074 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkciQ62074 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkciQ62074 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkciQ62074 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrkciQ62074 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkciQ62074 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkciQ62074 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrkciQ62074 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrkciQ62074 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrkciQ62074 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrkciQ62074 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrkciQ62074 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrkciQ62074 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrkciQ62074 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrkciQ62074 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrkciQ62074 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrkciQ62074 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrkciQ62074 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrkciQ62074 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrkciQ62074 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrkciQ62074 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrkciQ62074 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrkciQ62074 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PrkciQ62074 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrkciQ62074 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrkciQ62074 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PrkciQ62074 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrkciQ62074 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrkciQ62074 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PrkciQ62074 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PrkciQ62074 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PrkciQ62074 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PrkciQ62074 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PrkciQ62074 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrkciQ62074 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrkciQ62074 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrkciQ62074 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrkciQ62074 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrkciQ62074 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrkciQ62074 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrkciQ62074 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrkciQ62074 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrkciQ62074 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrkciQ62074 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrkciQ62074 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrkciQ62074 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrkciQ62074 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrkciQ62074 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrkciQ62074 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrkciQ62074 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrkciQ62074 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrkciQ62074 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrkciQ62074 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrkciQ62074 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrkciQ62074 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrkciQ62074 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PrkciQ62074 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrkciQ62074 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PrkciQ62074 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PrkciQ62074 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PrkciQ62074 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PrkciQ62074 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PrkciQ62074 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkciQ62074 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkciQ62074 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkciQ62074 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkciQ62074 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkciQ62074 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkciQ62074 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkciQ62074 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkciQ62074 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkciQ62074 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkciQ62074 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkciQ62074 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkciQ62074 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkciQ62074 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkciQ62074 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkciQ62074 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkciQ62074 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkciQ62074 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkciQ62074 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkciQ62074 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkciQ62074 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkciQ62074 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms