Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phox2aQ62066 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Phox2aQ62066 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phox2aQ62066 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phox2aQ62066 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phox2aQ62066 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phox2aQ62066 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Phox2aQ62066 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phox2aQ62066 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phox2aQ62066 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phox2aQ62066 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phox2aQ62066 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phox2aQ62066 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phox2aQ62066 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phox2aQ62066 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phox2aQ62066 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phox2aQ62066 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phox2aQ62066 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phox2aQ62066 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Phox2aQ62066 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phox2aQ62066 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phox2aQ62066 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phox2aQ62066 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phox2aQ62066 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phox2aQ62066 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phox2aQ62066 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phox2aQ62066 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phox2aQ62066 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phox2aQ62066 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phox2aQ62066 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phox2aQ62066 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phox2aQ62066 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phox2aQ62066 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phox2aQ62066 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phox2aQ62066 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phox2aQ62066 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phox2aQ62066 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phox2aQ62066 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phox2aQ62066 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phox2aQ62066 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phox2aQ62066 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms