Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ctr9Q62018 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ctr9Q62018 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ctr9Q62018 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ctr9Q62018 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ctr9Q62018 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ctr9Q62018 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ctr9Q62018 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ctr9Q62018 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ctr9Q62018 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ctr9Q62018 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ctr9Q62018 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ctr9Q62018 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ctr9Q62018 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ctr9Q62018 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ctr9Q62018 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ctr9Q62018 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ctr9Q62018 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ctr9Q62018 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ctr9Q62018 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ctr9Q62018 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ctr9Q62018 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ctr9Q62018 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ctr9Q62018 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ctr9Q62018 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ctr9Q62018 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ctr9Q62018 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ctr9Q62018 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ctr9Q62018 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ctr9Q62018 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ctr9Q62018 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ctr9Q62018 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ctr9Q62018 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ctr9Q62018 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ctr9Q62018 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ctr9Q62018 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ctr9Q62018 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ctr9Q62018 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ctr9Q62018 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ctr9Q62018 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ctr9Q62018 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ctr9Q62018 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ctr9Q62018 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ctr9Q62018 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ctr9Q62018 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ctr9Q62018 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ctr9Q62018 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ctr9Q62018 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ctr9Q62018 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ctr9Q62018 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ctr9Q62018 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ctr9Q62018 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ctr9Q62018 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ctr9Q62018 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ctr9Q62018 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ctr9Q62018 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ctr9Q62018 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ctr9Q62018 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ctr9Q62018 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ctr9Q62018 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ctr9Q62018 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ctr9Q62018 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ctr9Q62018 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ctr9Q62018 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ctr9Q62018 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ctr9Q62018 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ctr9Q62018 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ctr9Q62018 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ctr9Q62018 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ctr9Q62018 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ctr9Q62018 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ctr9Q62018 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ctr9Q62018 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ctr9Q62018 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ctr9Q62018 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ctr9Q62018 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ctr9Q62018 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ctr9Q62018 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ctr9Q62018 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ctr9Q62018 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ctr9Q62018 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ctr9Q62018 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ctr9Q62018 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ctr9Q62018 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ctr9Q62018 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ctr9Q62018 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ctr9Q62018 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ctr9Q62018 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ctr9Q62018 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ctr9Q62018 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ctr9Q62018 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ctr9Q62018 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ctr9Q62018 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ctr9Q62018 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ctr9Q62018 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ctr9Q62018 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ctr9Q62018 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ctr9Q62018 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ctr9Q62018 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ctr9Q62018 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms