Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrn1Q61809 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrn1Q61809 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrn1Q61809 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrn1Q61809 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrn1Q61809 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrn1Q61809 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrn1Q61809 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrn1Q61809 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrn1Q61809 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrn1Q61809 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrn1Q61809 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrn1Q61809 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrn1Q61809 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrn1Q61809 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrn1Q61809 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrn1Q61809 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrn1Q61809 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrn1Q61809 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrn1Q61809 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrn1Q61809 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrn1Q61809 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrn1Q61809 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrn1Q61809 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrn1Q61809 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrn1Q61809 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrn1Q61809 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrn1Q61809 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrn1Q61809 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrn1Q61809 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrn1Q61809 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrn1Q61809 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrn1Q61809 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrn1Q61809 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrn1Q61809 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrn1Q61809 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrn1Q61809 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrrn1Q61809 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrn1Q61809 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrn1Q61809 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrn1Q61809 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms