Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga7Q61738 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga7Q61738 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga7Q61738 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga7Q61738 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Itga7Q61738 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga7Q61738 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga7Q61738 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga7Q61738 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga7Q61738 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga7Q61738 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga7Q61738 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga7Q61738 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga7Q61738 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga7Q61738 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga7Q61738 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga7Q61738 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga7Q61738 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga7Q61738 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga7Q61738 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga7Q61738 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga7Q61738 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga7Q61738 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga7Q61738 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga7Q61738 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga7Q61738 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga7Q61738 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga7Q61738 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga7Q61738 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga7Q61738 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga7Q61738 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga7Q61738 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Itga7Q61738 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga7Q61738 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga7Q61738 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga7Q61738 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga7Q61738 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga7Q61738 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga7Q61738 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga7Q61738 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga7Q61738 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga7Q61738 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga7Q61738 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga7Q61738 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga7Q61738 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga7Q61738 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga7Q61738 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga7Q61738 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga7Q61738 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga7Q61738 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga7Q61738 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga7Q61738 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga7Q61738 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga7Q61738 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga7Q61738 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itga7Q61738 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itga7Q61738 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itga7Q61738 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itga7Q61738 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga7Q61738 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga7Q61738 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga7Q61738 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga7Q61738 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga7Q61738 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga7Q61738 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga7Q61738 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga7Q61738 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga7Q61738 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga7Q61738 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga7Q61738 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga7Q61738 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga7Q61738 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga7Q61738 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga7Q61738 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga7Q61738 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga7Q61738 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga7Q61738 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga7Q61738 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga7Q61738 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga7Q61738 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga7Q61738 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga7Q61738 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga7Q61738 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga7Q61738 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga7Q61738 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga7Q61738 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga7Q61738 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga7Q61738 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Itga7Q61738 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga7Q61738 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga7Q61738 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga7Q61738 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga7Q61738 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga7Q61738 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga7Q61738 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga7Q61738 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga7Q61738 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga7Q61738 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga7Q61738 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga7Q61738 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms